278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2499 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 246 aa  480  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  51.42 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  57.53 
 
 		 247 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  47.85 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  43.41 
 
 		 216 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 198 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  42.24 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 		 213 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  41.25 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1277  electron transport protein SCO1/SenC  43.53 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3024  electron transport protein SCO1/SenC  39.43 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  38.15 
 
 		 197 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  35.94 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  36.18 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  42.36 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  42.36 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  42.36 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  42.36 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  42.36 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  42.36 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  36.22 
 
 		 197 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  35.18 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  33.18 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  41.67 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 205 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 205 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  35.79 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 191 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  35.07 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  35.79 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  35.07 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  37.42 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  37.36 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.66 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  35.38 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  35.38 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  35.38 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  35.38 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  35.38 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  36.81 
 
 		 181 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  36.81 
 
 		 181 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  34.24 
 
 		 210 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 		 205 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  36.69 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  34.83 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  33.16 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  38.12 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  32.84 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.7 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  39.26 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0405  electron transport protein SCO1/SenC  33.67 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  37.5 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  39.26 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 201 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 211 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  32.97 
 
 		 207 aa  99.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  37.09 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  32.1 
 
 		 207 aa  99  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  39.73 
 
 		 220 aa  99  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  37.58 
 
 		 211 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 191 aa  98.6  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  40.28 
 
 		 211 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  39.16 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  38.03 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  34.83 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  38.03 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  38.03 
 
 		 217 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 231 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  30.53 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  27.66 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  36.59 
 
 		 210 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  31.31 
 
 		 196 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 211 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  37.23 
 
 		 197 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  35.15 
 
 		 195 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  38.33 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  33.52 
 
 		 204 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  37.76 
 
 		 211 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
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NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  37.76 
 
 		 211 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  37.76 
 
 		 211 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 209 aa  92.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 		 208 aa  92  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 192 aa  91.7  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  42.37 
 
 		 209 aa  91.7  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
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BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  31.68 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc0373  lipoprotein  35.71 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  34.29 
 
 		 194 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
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