More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1555 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  32.03 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  29.6 
 
 		 135 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 135 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 		 135 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  48.05 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  45.57 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  51.52 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  53.03 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  46.84 
 
 		 145 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 135 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  46.03 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  33.6 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 252 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  33.6 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  50.68 
 
 		 258 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.58 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.58 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.17 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  44.58 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 648 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  49.28 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  35.9 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  46.58 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  41.33 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.58 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 146 aa  62  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  51.61 
 
 		 339 aa  61.6  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 144 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  43.94 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  43.04 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  47.14 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 630 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 141 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  33.61 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 630 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  46.97 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  36.57 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.28 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 639 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  46.97 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>