More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1291 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1291  recombinase A  100 
 
 		 357 aa  716    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260339  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1158  recombinase A  78.51 
 
 		 349 aa  553  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0960  recombinase A  73.11 
 
 		 356 aa  500  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00998532  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0938  recombinase A  72.46 
 
 		 356 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126109  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0081  recombinase A  63.64 
 
 		 368 aa  463  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.449837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  59.76 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  60.55 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  58.43 
 
 		 342 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  60.49 
 
 		 343 aa  411  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  59.34 
 
 		 365 aa  411  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  60.54 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  60.49 
 
 		 343 aa  411  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  62.16 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  62.03 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  62.03 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  62.03 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  57.77 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  62.03 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  62.03 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  62.03 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  62.03 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  56.25 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  61.08 
 
 		 356 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  59.64 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  57.77 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  57.65 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  59.63 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  58.89 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  60.67 
 
 		 341 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  59.04 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  59.94 
 
 		 350 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  60.24 
 
 		 350 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  59.51 
 
 		 424 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  59.63 
 
 		 376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  59.51 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  59.94 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  60.37 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  57.19 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  57.19 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  59.94 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  57.8 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  56.4 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  59.51 
 
 		 361 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  55.68 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  58.66 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  59.63 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  57.35 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  59.51 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  57.57 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  59.94 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  60.44 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  61.39 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  56.66 
 
 		 364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  58.97 
 
 		 358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  57.57 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  59.57 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  59.64 
 
 		 345 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  57.86 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  59.94 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  58.97 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  58.13 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  56.93 
 
 		 378 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  58.66 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  60.44 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  57.69 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  59.81 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  56.18 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  56.3 
 
 		 383 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  59.33 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  59.81 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  57.69 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  60.06 
 
 		 387 aa  401  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  56.37 
 
 		 376 aa  403  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  59.05 
 
 		 385 aa  403  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  58.72 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  59.08 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  58.95 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  59.51 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  58.13 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  58.13 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  57.54 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  59.21 
 
 		 346 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  59.5 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  58.13 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  57.27 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  59.7 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  55.17 
 
 		 363 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  57.83 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  54.89 
 
 		 363 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  58.23 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  58.13 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  58.9 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  58.13 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  59.7 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  57.35 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  58.43 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  59.58 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  57.19 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  55.81 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  54.6 
 
 		 362 aa  394  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>