155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0934 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  100 
 
 
302 aa  627  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  39.24 
 
 
328 aa  218  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  45.41 
 
 
351 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  44.98 
 
 
351 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  37.91 
 
 
352 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  37.5 
 
 
360 aa  192  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  29.19 
 
 
355 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  34.04 
 
 
353 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  32.91 
 
 
353 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  29.37 
 
 
353 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  35.15 
 
 
347 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  36 
 
 
340 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  25.09 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  39.04 
 
 
348 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  28.29 
 
 
353 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  29.2 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  24.73 
 
 
371 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  33.53 
 
 
331 aa  92.8  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  37.91 
 
 
364 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  27.49 
 
 
383 aa  90.1  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  32.48 
 
 
348 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  23.55 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  30.36 
 
 
379 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  30.36 
 
 
372 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  28.68 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  31.54 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.59 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  30.59 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.61 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  30.36 
 
 
372 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  26.52 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  32.88 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  31.29 
 
 
369 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  24.36 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  30.61 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.12 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  30.2 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  30.61 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.55 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.61 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  24.8 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  31.33 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  30.41 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.68 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  29.5 
 
 
414 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  30.41 
 
 
367 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.72 
 
 
341 aa  62.8  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  32.74 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  26.88 
 
 
341 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.56 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  27.37 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  27.37 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.38 
 
 
367 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  26.88 
 
 
505 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.57 
 
 
418 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.07 
 
 
334 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  33.08 
 
 
365 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  29.45 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.1 
 
 
332 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  27.21 
 
 
308 aa  50.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.43 
 
 
414 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  28.38 
 
 
368 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  28.76 
 
 
332 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.14 
 
 
351 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  28.38 
 
 
368 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  26.23 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.24 
 
 
354 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.33 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.8 
 
 
325 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  26.06 
 
 
325 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  25 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  25.41 
 
 
318 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.57 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  24.86 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  22.73 
 
 
362 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.21 
 
 
331 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.84 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.16 
 
 
338 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  24.28 
 
 
339 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.35 
 
 
327 aa  45.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.37 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  26.99 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  20.41 
 
 
489 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.54 
 
 
521 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  26.99 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.91 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  23.14 
 
 
379 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  25.62 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.54 
 
 
332 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25 
 
 
332 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  24.28 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  28.08 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  25.27 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  24.17 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2401  ATPase  24.84 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.284187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  25.27 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0039  ATPase  26 
 
 
333 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  25.99 
 
 
347 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  24.21 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>