More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3957 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3957  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  251  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  71.43 
 
 		 119 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1349  transcriptional regulator, HxlR family  64.6 
 
 		 128 aa  164  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124535 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  62.83 
 
 		 116 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  44.17 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  41.59 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  52.75 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  50.55 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  51.65 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  51.65 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  51.65 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  51.65 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  51.65 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  51.65 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  51.65 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  55.42 
 
 		 124 aa  95.9  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  49.48 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  47.25 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  46.94 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  46.94 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  46.94 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  46.94 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  46.94 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  46.94 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  45.36 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  47.25 
 
 		 129 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 114 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  47.78 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  47.25 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 180 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  40.95 
 
 		 206 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  41.96 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  41.35 
 
 		 220 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 119 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  45.05 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  45.05 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  44.09 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  45.05 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  45.05 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  45.05 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  45.05 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  38.74 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.01 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3102  MarR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  47.83 
 
 		 122 aa  87.4  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  52.5 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  43.82 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0337  transcriptional regulator  47.47 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  41.75 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 108 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  43.82 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  41.75 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  43.62 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  45.74 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  41.75 
 
 		 108 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>