More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2561 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2561  C-terminal processing peptidase  100 
 
 
676 aa  1373    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0632  C-terminal processing peptidase-1  26.86 
 
 
705 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1252  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 
697 aa  258  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1953  carboxyl-terminal protease  27.35 
 
 
711 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1304  C-terminal processing peptidase-1  31.65 
 
 
680 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0729  peptidase S41A, C-terminal protease  31.61 
 
 
683 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1366  carboxyl-terminal protease  31.54 
 
 
687 aa  253  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1046  carboxyl-terminal protease  29.55 
 
 
693 aa  251  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000142201  unclonable  0.00000192026 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04840  probable periplasmic tail-specific proteinase  30.54 
 
 
706 aa  251  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1022  peptidase S41A, C-terminal protease  31.73 
 
 
707 aa  248  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000400969  normal  0.0227897 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1326  carboxyl-terminal protease  29.55 
 
 
674 aa  246  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.91473  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1679  C-terminal processing peptidase-1  30.02 
 
 
705 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054588  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1599  peptidase S41A, C-terminal protease  30.53 
 
 
704 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0464892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3885  tail-specific protease  30.36 
 
 
693 aa  244  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1430  carboxyl-terminal protease  28.83 
 
 
727 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1328  C-terminal processing peptidase-1  30.33 
 
 
694 aa  240  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0242336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1719  carboxyl-terminal protease  30.02 
 
 
704 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0889073  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1268  carboxyl-terminal protease  29.82 
 
 
693 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000748265  normal  0.0247488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4000  carboxyl-terminal protease  29.84 
 
 
704 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00109251  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1363  carboxyl-terminal protease  30.8 
 
 
688 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1321  carboxyl-terminal protease  30.65 
 
 
704 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184977  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1311  carboxyl-terminal protease  28.95 
 
 
693 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.299557 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0003  carboxyl-terminal protease  28.71 
 
 
702 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4122  carboxyl-terminal protease  29.22 
 
 
697 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6521  carboxyl-terminal protease  31.03 
 
 
709 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1217  carboxyl-terminal protease  29.82 
 
 
674 aa  229  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35170  C-terminal peptidase, S41A subfamily  29.83 
 
 
693 aa  227  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.422257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1868  periplasmic tail-specific protease  29.95 
 
 
699 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.435516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21880  periplasmic tail-specific protease  29.79 
 
 
698 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0932853  hitchhiker  0.00000629787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2146  C-terminal processing peptidase-1  27.58 
 
 
712 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.19614 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1658  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  29.36 
 
 
719 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305852  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3441  carboxyl-terminal protease  28.87 
 
 
725 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0836072  normal  0.132534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2885  carboxyl-terminal protease  28.39 
 
 
698 aa  212  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000352387  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  29.93 
 
 
721 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1152  carboxyl-terminal protease  28.6 
 
 
683 aa  210  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1519  C-terminal processing peptidase-1  28.76 
 
 
698 aa  209  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4634  carboxyl-terminal protease  29.43 
 
 
709 aa  209  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0425581  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04290  tail-specific protease  27.03 
 
 
719 aa  206  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5898  carboxyl-terminal protease  28.94 
 
 
705 aa  204  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  28.55 
 
 
680 aa  204  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5403  carboxyl-terminal protease  28.81 
 
 
705 aa  203  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1200  C-terminal processing peptidase  27.17 
 
 
727 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1994  C-terminal processing peptidase-1  29.16 
 
 
703 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.754178  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1106  carboxyl-terminal protease  27.31 
 
 
727 aa  201  5e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1993  carboxy-terminal protease  29.16 
 
 
679 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000930411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2810  carboxy-terminal protease  29.11 
 
 
683 aa  197  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1544  carboxy-terminal protease  27.51 
 
 
672 aa  196  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1071  carboxy-terminal protease  26.46 
 
 
675 aa  196  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.461658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1802  carboxy-terminal protease  27.57 
 
 
681 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.308146  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1631  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 
748 aa  195  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1783  carboxy-terminal protease  26.88 
 
 
692 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00680502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2483  carboxy-terminal protease  27.37 
 
 
690 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000106803  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0315  carboxyl-terminal protease  28.3 
 
 
735 aa  194  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144056  hitchhiker  0.0000288236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1672  carboxy-terminal protease  26.88 
 
 
690 aa  194  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000704013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  28.64 
 
 
664 aa  193  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2059  carboxy-terminal protease  27.69 
 
 
682 aa  193  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1593  C-terminal processing peptidase-1  27 
 
 
708 aa  193  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01801  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  27.69 
 
 
682 aa  193  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01789  hypothetical protein  27.69 
 
 
682 aa  193  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1921  carboxy-terminal protease  27.69 
 
 
682 aa  193  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2098  carboxy-terminal protease  27.69 
 
 
682 aa  193  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1802  carboxy-terminal protease  27.69 
 
 
682 aa  193  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0594829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1812  carboxyl-terminal protease  27.69 
 
 
682 aa  193  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2563  carboxy-terminal protease  27.69 
 
 
680 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000036056  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2141  carboxy-terminal protease  27.65 
 
 
671 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1357  carboxy-terminal protease  27.69 
 
 
680 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000834708  normal  0.174046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003431  tail-specific protease precursor  27.02 
 
 
668 aa  192  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00461835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0166  carboxyl-terminal protease  26.17 
 
 
726 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2663  carboxy-terminal protease  26.74 
 
 
689 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000297932  hitchhiker  0.0063771 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2046  carboxy-terminal protease  28.12 
 
 
682 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  27.95 
 
 
664 aa  192  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1470  carboxy-terminal protease  27.94 
 
 
682 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0690257  normal  0.257685 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1988  carboxy-terminal protease  27.94 
 
 
698 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547675  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1722  carboxy-terminal protease  27.53 
 
 
683 aa  191  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000352033  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1286  carboxy-terminal protease  27.94 
 
 
682 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000018564  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1984  carboxy-terminal protease  27.94 
 
 
682 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00711922  hitchhiker  0.00523275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2133  carboxy-terminal protease  27.46 
 
 
690 aa  191  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000755516  normal  0.0766103 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0309  carboxyl-terminal protease  27.64 
 
 
737 aa  191  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0982282  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  26.45 
 
 
665 aa  190  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1585  carboxy-terminal protease  27.59 
 
 
681 aa  190  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00663256  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  27.08 
 
 
671 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2400  carboxy-terminal protease  26.53 
 
 
682 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0282  C-terminal processing peptidase-1  27.67 
 
 
737 aa  188  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610921  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2228  carboxy-terminal protease  27.75 
 
 
683 aa  187  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.128038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1904  carboxy-terminal protease  27.48 
 
 
681 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239407  normal  0.209201 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2440  carboxy-terminal protease  27.27 
 
 
681 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1845  carboxy-terminal protease  27.55 
 
 
673 aa  185  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1673  carboxy-terminal protease  27 
 
 
683 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274964  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2560  carboxy-terminal protease  27.27 
 
 
681 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.21905  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1748  carboxy-terminal protease  27 
 
 
683 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0158568  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2447  carboxy-terminal protease  27.27 
 
 
681 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  28.26 
 
 
678 aa  184  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1778  carboxy-terminal protease  26.47 
 
 
683 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0159186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1935  carboxy-terminal protease  26.72 
 
 
681 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.487036  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2074  carboxy-terminal protease  26.96 
 
 
673 aa  181  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2601  carboxy-terminal protease  27 
 
 
682 aa  181  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0121  carboxyl-terminal protease  25.99 
 
 
706 aa  181  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2202  carboxy-terminal protease  27.34 
 
 
681 aa  180  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.846279  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3496  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 
743 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.847425  normal  0.281142 
 
 
-
 
NC_002620  TC0725  tail specific protease precursor, putative  29.38 
 
 
649 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>