More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1520 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  313  8e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 153 aa  222  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  55.26 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 150 aa  180  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  51.77 
 
 		 153 aa  168  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  48.25 
 
 		 167 aa  158  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  46.98 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  51.68 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  43.05 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  41.5 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  40.27 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.42 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2868  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  37.58 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2595  transcriptional regulator, AsnC family  40.94 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  35.33 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 166 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  34.67 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 155 aa  120  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  37.16 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.91 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.33 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  36.24 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  36.24 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.89 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 		 159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 181 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  35.81 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  35.81 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  35.81 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  35.81 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 157 aa  116  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  35.81 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  37.01 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 166 aa  115  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  36.73 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  35.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>