239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0379 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 60 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  65.52 
 
 		 58 aa  84.3  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  66.67 
 
 		 60 aa  80.9  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  66.1 
 
 		 59 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2047  ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000587812  hitchhiker  0.00892932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 62 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  43.33 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 51 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3144  50S ribosomal protein L30P  51.72 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00426449  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 56 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0346  ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0149627  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  44.83 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  46.55 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  65.71 
 
 		 57 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  65.71 
 
 		 57 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  50.8  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  44.83 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 56 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  47.17 
 
 		 59 aa  50.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  48.28 
 
 		 58 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  49.15 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  50.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0785  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00447996  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1244  50S ribosomal protein L30P  43.64 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186097  hitchhiker  0.00279952 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  46.67 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>