More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0128 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 137 aa  280  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  66.91 
 
 		 138 aa  202  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  67.15 
 
 		 144 aa  202  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  70.59 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.31 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.97 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2174  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.31 
 
 		 140 aa  173  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.47 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.63 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  48.91 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 148 aa  144  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 144 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 152 aa  143  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.48 
 
 		 184 aa  143  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.92 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 146 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 146 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 177 aa  139  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  44.85 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  51.54 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 145 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  47.41 
 
 		 193 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  49.25 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  49.25 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  49.25 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  45.32 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  47.76 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 162 aa  133  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.92 
 
 		 160 aa  133  7.000000000000001e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  49.25 
 
 		 158 aa  133  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  46.27 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.48 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>