57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3893 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 
201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  85 
 
 
201 aa  329  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  60.21 
 
 
201 aa  243  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  56.72 
 
 
201 aa  231  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  34.9 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  35.53 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.49 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.96 
 
 
248 aa  88.2  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  28.24 
 
 
232 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  25.68 
 
 
228 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  27.61 
 
 
218 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  27.61 
 
 
218 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.72 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  29.7 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.82 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  32.47 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  28.96 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  24.29 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  28.42 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  26.37 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  31.96 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  30.86 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  31.66 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  31.66 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  26.92 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  24.85 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  27.78 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  32.28 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  26.78 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  26.47 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  29.7 
 
 
280 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  25.64 
 
 
225 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  27.71 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  28.4 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  26.67 
 
 
198 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  28.25 
 
 
173 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  26.99 
 
 
213 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  26.99 
 
 
213 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  28.48 
 
 
272 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  27.65 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  28.48 
 
 
272 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1495  hypothetical protein  24.38 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.635359  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  26.42 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  26.7 
 
 
270 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  25.95 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  26.46 
 
 
267 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  23.42 
 
 
216 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  25.82 
 
 
271 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  23.7 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0433  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.03 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  22.67 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  27.57 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  23.31 
 
 
194 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  26.37 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.34 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  22.97 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>