131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0222 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0222  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  566  1e-160  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012107 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0735  radical SAM domain-containing protein  62.89 
 
 		 282 aa  344  7e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14080  DNA repair photolyase  53.39 
 
 		 256 aa  308  8e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2493  Radical SAM domain protein  50.4 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2021  radical SAM domain-containing protein  58.49 
 
 		 109 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  29.47 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  31.11 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5485  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.269586 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0962  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  27.37 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 395 aa  58.9  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  25.81 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  25.59 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 385 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 385 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 385 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 385 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  25.81 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 383 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 385 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2193  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00124948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  25.85 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  24.74 
 
 		 387 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  24.06 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 381 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  24.74 
 
 		 386 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  25.64 
 
 		 393 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  22.5 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  26.41 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  24.21 
 
 		 386 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  24.74 
 
 		 387 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1163  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000309895 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1314  Radical SAM domain protein  22.33 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.263305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 386 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  24.32 
 
 		 360 aa  52.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 362 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  24.87 
 
 		 356 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 362 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  24.74 
 
 		 352 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.42 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 390 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  25.4 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  25.4 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  24.34 
 
 		 362 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 437 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  24.23 
 
 		 384 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 371 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  23.28 
 
 		 360 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 374 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 356 aa  49.3  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 389 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 372 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 362 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 374 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  21.88 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>