202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2891 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2891  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
265 aa  549  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
149 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 
159 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
113 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
145 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  31.45 
 
 
152 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
154 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 
152 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
390 aa  52.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
143 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
157 aa  52.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
392 aa  52.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
145 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3082  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 
117 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1323  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
152 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
147 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
398 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  32.99 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
391 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  30.7 
 
 
390 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  39.44 
 
 
176 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  40.85 
 
 
157 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  39.44 
 
 
171 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  39.44 
 
 
171 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  31.58 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  39.44 
 
 
176 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  39.44 
 
 
156 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
162 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
128 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  39.44 
 
 
157 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
138 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
117 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  32.47 
 
 
177 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
128 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
137 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
163 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 
135 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 
133 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
133 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
157 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 
133 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
125 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
159 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  32.03 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
149 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
164 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
130 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
136 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 
122 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
140 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
155 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 
124 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
113 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
391 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  26.23 
 
 
138 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  29.7 
 
 
138 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
138 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 
122 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
122 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  23.84 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
121 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
122 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 
122 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
122 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
162 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  23.84 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
121 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  35.21 
 
 
159 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
133 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.67 
 
 
132 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
390 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 
122 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
159 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
154 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  37.88 
 
 
133 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
156 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  36.62 
 
 
173 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  33.82 
 
 
171 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
149 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
149 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  23.84 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  32.86 
 
 
112 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2331  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 
141 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00979491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 
183 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  39.06 
 
 
137 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
137 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  30 
 
 
135 aa  46.2  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  25.45 
 
 
130 aa  45.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3479  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
156 aa  45.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
128 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
129 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 
142 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 
142 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 
142 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 
142 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>