More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1467 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0836  excinuclease ATPase subunit  72.63 
 
 
862 aa  1183    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1467  ABC transporter related  100 
 
 
843 aa  1700    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0955  ABC transporter related  47.48 
 
 
837 aa  777    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0686  ABC transporter related  64.86 
 
 
843 aa  1090    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.409076 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19390  Excinuclease ATPase subunit  71.08 
 
 
837 aa  1181    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1665  excinuclease ATPase subunit  46.64 
 
 
846 aa  760    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2119  ABC transporter related  62.58 
 
 
836 aa  993    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  37.17 
 
 
834 aa  524  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  38.64 
 
 
838 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  39.1 
 
 
838 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  38.22 
 
 
850 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  38.61 
 
 
838 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  37.73 
 
 
844 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  37.17 
 
 
877 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  37.79 
 
 
853 aa  513  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  37 
 
 
843 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  38.57 
 
 
860 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  38.57 
 
 
827 aa  505  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  38.64 
 
 
848 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  41.51 
 
 
776 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  38.71 
 
 
843 aa  500  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  38.64 
 
 
848 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  38.88 
 
 
880 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  38.53 
 
 
848 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  37.72 
 
 
861 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  36.71 
 
 
822 aa  498  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  37.83 
 
 
832 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  36.95 
 
 
899 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  34.47 
 
 
820 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  40 
 
 
845 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  38.59 
 
 
838 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  37.05 
 
 
950 aa  482  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  36.96 
 
 
897 aa  479  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  37.22 
 
 
885 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  36.96 
 
 
944 aa  478  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  36.77 
 
 
898 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  36.55 
 
 
898 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  37.5 
 
 
863 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  38.74 
 
 
958 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  38.74 
 
 
958 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  38.77 
 
 
952 aa  471  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  36.51 
 
 
899 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  38.74 
 
 
958 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  38.74 
 
 
958 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  38.59 
 
 
958 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  39.66 
 
 
945 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  38.74 
 
 
958 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  38.74 
 
 
958 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  38.59 
 
 
833 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  36.14 
 
 
894 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  40.09 
 
 
955 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  39.54 
 
 
948 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  39.68 
 
 
954 aa  466  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  38.45 
 
 
958 aa  465  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  39.54 
 
 
948 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  38.16 
 
 
959 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  38.29 
 
 
953 aa  463  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  38.59 
 
 
958 aa  465  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  33.49 
 
 
823 aa  465  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  37.2 
 
 
851 aa  465  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  39.83 
 
 
965 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  38.07 
 
 
956 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  38.75 
 
 
964 aa  460  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  37.39 
 
 
947 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  39.57 
 
 
946 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  39.83 
 
 
966 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  39.68 
 
 
966 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  40.17 
 
 
947 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  38.74 
 
 
941 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  37.74 
 
 
944 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  35.71 
 
 
881 aa  462  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  37.54 
 
 
947 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  38.14 
 
 
937 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1015  excinuclease ABC subunit A  39.89 
 
 
977 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.198775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1170  excinuclease ABC, A subunit  38.18 
 
 
973 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  37.92 
 
 
946 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  39.6 
 
 
916 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  36.89 
 
 
945 aa  455  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  37.16 
 
 
1008 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  37.86 
 
 
937 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0538  excinuclease ABC subunit A  39.68 
 
 
970 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  39.74 
 
 
971 aa  456  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  36.52 
 
 
939 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  37.64 
 
 
942 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  39.45 
 
 
946 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  37.63 
 
 
931 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  37.64 
 
 
946 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3893  excinuclease ABC subunit A  37.03 
 
 
957 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0968231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  38.6 
 
 
946 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  38.56 
 
 
970 aa  452  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  37.91 
 
 
947 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  36.91 
 
 
939 aa  452  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  38.77 
 
 
953 aa  452  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  38.11 
 
 
944 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1709  excinuclease ABC subunit A  38.12 
 
 
942 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  37.82 
 
 
946 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  38.64 
 
 
987 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  38.02 
 
 
934 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  38.26 
 
 
941 aa  449  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2252  excinuclease ABC subunit A  38.19 
 
 
959 aa  448  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174561  normal  0.0315795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>