More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1323 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 156 aa  321  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.431138  normal  0.429518 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09600  predicted rRNA methylase SpoU family  62.99 
 
 		 159 aa  204  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.66 
 
 		 162 aa  180  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.6 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  53.95 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  55.63 
 
 		 153 aa  170  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.32 
 
 		 154 aa  167  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  52.32 
 
 		 152 aa  167  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  53.64 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  51.95 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.34 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  54.97 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.63 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  48.68 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.39 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  47.4 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.99 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  49.67 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  48.03 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  47.4 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  47.4 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  47.4 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  47.4 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.4 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.4 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  47.4 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.4 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.4 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  46.75 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  48.37 
 
 		 169 aa  154  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.44 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  48.7 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.37 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  48.7 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.81 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.67 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.57 
 
 		 172 aa  147  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3322  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.32 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000129205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0924  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.32 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.73808e-35 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1588  RNA methyltransferase  46.41 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000775856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.33 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  48.99 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.21 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.33 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.33 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  50.33 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  46.1 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  50.33 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.33 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.33 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.65 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.33 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.33 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1346  rRNA methylase (SpoU class)  43.79 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  49.66 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  49.01 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  49.01 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  50.34 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.7 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.97 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0129  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  49.01 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48.34 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  48.34 
 
 		 177 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.66 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  46.79 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0658  rRNA methylase (SpoU class)  44.52 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.28 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48.34 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48.34 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  49.67 
 
 		 157 aa  136  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  46.79 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  46.79 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  46.79 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.97 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0823  tRNA/rRNA methyltransferase  43.24 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2460  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.36 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000877061 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  43.23 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  48.03 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0552  RNA methyltransferase  46.67 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242542  normal  0.84663 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1574  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.31 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.34 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  48.37 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  48.37 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  45.7 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  45.03 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1452  putative rRNA methylase  45.7 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000390375  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1629  tRNA/rRNA methyltransferase  44.97 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2768  RNA methyltransferase  48.37 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  45.7 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  45.7 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  45.7 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  45.7 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  48.37 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0422  RNA methyltransferase  49.67 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0503  RNA methyltransferase  49.02 
 
 		 179 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.71 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  45.03 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  49.35 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1418  RNA methyltransferase  49.02 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.82 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>