270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0653 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  41.79 
 
 		 829 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  97.2 
 
 		 822 aa  1655    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 832 aa  1717    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  97.41 
 
 		 821 aa  1638    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  40.78 
 
 		 816 aa  642    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  97.28 
 
 		 812 aa  1636    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.52 
 
 		 832 aa  757    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  42.02 
 
 		 829 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  98.8 
 
 		 833 aa  1696    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  41.79 
 
 		 829 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  41.55 
 
 		 829 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  97.96 
 
 		 834 aa  1687    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  41.55 
 
 		 829 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4106  fimbrial usher protein  44.52 
 
 		 830 aa  754    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.93 
 
 		 819 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  40.05 
 
 		 833 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  39.93 
 
 		 833 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  39.68 
 
 		 816 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.85 
 
 		 818 aa  612  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  39.8 
 
 		 833 aa  612  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  39.95 
 
 		 792 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.69 
 
 		 835 aa  598  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.9 
 
 		 828 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.85 
 
 		 844 aa  575  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  36.71 
 
 		 826 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  36.47 
 
 		 826 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.47 
 
 		 845 aa  549  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.39 
 
 		 846 aa  548  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.35 
 
 		 826 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  36.48 
 
 		 885 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  36.48 
 
 		 885 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  36.25 
 
 		 885 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  36.25 
 
 		 885 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3480  fimbrial usher protein  36.45 
 
 		 860 aa  527  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  37.73 
 
 		 881 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  37.38 
 
 		 881 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  37.5 
 
 		 881 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  37.62 
 
 		 881 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  35.84 
 
 		 880 aa  519  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  35.15 
 
 		 882 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  35.72 
 
 		 880 aa  519  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2632  fimbrial usher family protein  35.68 
 
 		 881 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  35.44 
 
 		 881 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1315  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.52 
 
 		 881 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.32 
 
 		 828 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.21 
 
 		 829 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.21 
 
 		 828 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2061  MrfC  33.88 
 
 		 813 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230274  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.21 
 
 		 828 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.09 
 
 		 828 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.21 
 
 		 828 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.88 
 
 		 813 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1897  fimbrial usher protein  33.75 
 
 		 813 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1910  fimbrial usher protein  33.75 
 
 		 813 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.87 
 
 		 817 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02223  hypothetical protein  36.59 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04794  porin PapC  30.46 
 
 		 820 aa  335  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  29.92 
 
 		 878 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  29.92 
 
 		 878 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  29.33 
 
 		 878 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.8 
 
 		 878 aa  310  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  29.45 
 
 		 863 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  29.21 
 
 		 856 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  31.06 
 
 		 838 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  31.06 
 
 		 838 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.82 
 
 		 838 aa  295  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  30.94 
 
 		 838 aa  295  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  30.74 
 
 		 848 aa  294  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  30.58 
 
 		 863 aa  294  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.18 
 
 		 859 aa  294  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  30.74 
 
 		 848 aa  294  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  30.86 
 
 		 848 aa  293  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  30.58 
 
 		 838 aa  293  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.94 
 
 		 838 aa  292  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  30.74 
 
 		 848 aa  292  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  30.67 
 
 		 848 aa  291  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.75 
 
 		 851 aa  291  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.36 
 
 		 851 aa  290  9e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.81 
 
 		 861 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.81 
 
 		 877 aa  285  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  29.27 
 
 		 850 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  29.41 
 
 		 833 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  29.82 
 
 		 866 aa  284  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  29.68 
 
 		 809 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  28.77 
 
 		 851 aa  283  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  28.88 
 
 		 833 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  29.34 
 
 		 833 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  29.55 
 
 		 809 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  29.55 
 
 		 809 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  29.15 
 
 		 839 aa  282  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  29.55 
 
 		 809 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  29.55 
 
 		 809 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  29.06 
 
 		 840 aa  280  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  28.22 
 
 		 870 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  28.1 
 
 		 870 aa  279  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  27.98 
 
 		 870 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.59 
 
 		 865 aa  278  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  28.1 
 
 		 870 aa  278  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  27.94 
 
 		 861 aa  278  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.12 
 
 		 857 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>