68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2661 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  74.28 
 
 		 730 aa  1125    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  74.15 
 
 		 730 aa  1151    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  73.73 
 
 		 730 aa  1145    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  100 
 
 		 724 aa  1503    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  73.19 
 
 		 730 aa  1135    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  74.01 
 
 		 730 aa  1150    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  36.14 
 
 		 5337 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  36.14 
 
 		 4953 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  36.14 
 
 		 2933 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  37.4 
 
 		 1976 aa  277  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  44.41 
 
 		 2795 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  39.75 
 
 		 2933 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  37.56 
 
 		 1084 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  34.3 
 
 		 969 aa  265  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  34.08 
 
 		 941 aa  263  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  35.53 
 
 		 1417 aa  261  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  35.03 
 
 		 1417 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  35.03 
 
 		 1417 aa  259  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  35.03 
 
 		 1418 aa  258  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  35.03 
 
 		 1396 aa  258  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  32.75 
 
 		 1075 aa  257  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  35.64 
 
 		 1050 aa  257  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  34.89 
 
 		 2358 aa  257  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  31.44 
 
 		 1075 aa  257  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  34.89 
 
 		 2367 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  34.89 
 
 		 2383 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  34.89 
 
 		 2358 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  34.64 
 
 		 2296 aa  252  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  34.89 
 
 		 2620 aa  252  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  34.17 
 
 		 497 aa  246  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  32.59 
 
 		 934 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  35.95 
 
 		 1746 aa  243  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  32.34 
 
 		 468 aa  234  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  32.33 
 
 		 509 aa  220  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  32.54 
 
 		 474 aa  220  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  32.54 
 
 		 474 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  32.11 
 
 		 474 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  32.11 
 
 		 474 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  31.76 
 
 		 464 aa  203  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  31.53 
 
 		 476 aa  203  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  31.53 
 
 		 464 aa  203  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  31.53 
 
 		 476 aa  203  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  31.53 
 
 		 464 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  31.31 
 
 		 464 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  32.34 
 
 		 417 aa  200  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  32.34 
 
 		 417 aa  200  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  42.73 
 
 		 410 aa  200  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  31.08 
 
 		 464 aa  198  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  46 
 
 		 292 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  46 
 
 		 295 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  29.55 
 
 		 660 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  28.92 
 
 		 660 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  29.55 
 
 		 660 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  29.29 
 
 		 660 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  29.04 
 
 		 660 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  31.16 
 
 		 1459 aa  142  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  30.22 
 
 		 690 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  26.69 
 
 		 543 aa  105  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2773  hypothetical protein  34.92 
 
 		 320 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2753  hypothetical protein  36.28 
 
 		 321 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0353095 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2884  putative outer membrane protein  35.4 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  27.38 
 
 		 302 aa  62  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  40 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2667  hypothetical protein  35.71 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2660  putative adhesin  31.25 
 
 		 330 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.468628 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0759  hypothetical protein  30.77 
 
 		 291 aa  44.3  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415952  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0691  hypothetical protein  30.77 
 
 		 291 aa  43.9  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>