More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1677 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1581  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  98.4 
 
 		 561 aa  1126    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.477042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01454  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  98.22 
 
 		 561 aa  1123    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  98.4 
 
 		 561 aa  1125    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 561 aa  1145    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1760  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  98.04 
 
 		 561 aa  1122    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  98.75 
 
 		 561 aa  1132    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01467  hypothetical protein  98.22 
 
 		 561 aa  1123    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1686  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein yddA  98.22 
 
 		 561 aa  1127    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  98.57 
 
 		 561 aa  1126    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  36.92 
 
 		 553 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  36.01 
 
 		 557 aa  359  7e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  36.02 
 
 		 557 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  34.17 
 
 		 613 aa  347  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  33.82 
 
 		 610 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  33.92 
 
 		 614 aa  342  7e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  34.45 
 
 		 575 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.97 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  33.33 
 
 		 586 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  34.57 
 
 		 563 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  33.27 
 
 		 588 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.17 
 
 		 584 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 		 588 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 		 588 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 		 588 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.17 
 
 		 588 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  30.63 
 
 		 593 aa  320  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.17 
 
 		 588 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  32.9 
 
 		 583 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  32.97 
 
 		 577 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  32.9 
 
 		 589 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.9 
 
 		 589 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  32.9 
 
 		 589 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  32.9 
 
 		 589 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 		 588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  33.27 
 
 		 630 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  33.83 
 
 		 579 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  32.72 
 
 		 589 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  32.78 
 
 		 590 aa  311  1e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.09 
 
 		 592 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  30.58 
 
 		 621 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  31.05 
 
 		 636 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  32.54 
 
 		 589 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  32.68 
 
 		 583 aa  309  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  32.25 
 
 		 606 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0603  ABC transporter domain protein  34.69 
 
 		 596 aa  303  7.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.81 
 
 		 587 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  30.81 
 
 		 587 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  32.35 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 577 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  31.68 
 
 		 596 aa  294  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  34.5 
 
 		 572 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  29.47 
 
 		 599 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  33.95 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  30.13 
 
 		 614 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  32.96 
 
 		 560 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  29.95 
 
 		 614 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  30.98 
 
 		 603 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  30.16 
 
 		 614 aa  279  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  31.63 
 
 		 596 aa  277  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  30.05 
 
 		 712 aa  277  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  30.55 
 
 		 588 aa  273  9e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  31.64 
 
 		 595 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.87 
 
 		 598 aa  270  5e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  29.42 
 
 		 651 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  30.6 
 
 		 713 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  33.47 
 
 		 615 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  33.27 
 
 		 602 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  29.15 
 
 		 701 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  33.33 
 
 		 626 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  32.08 
 
 		 606 aa  263  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  32.08 
 
 		 605 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  30.15 
 
 		 635 aa  259  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  31.63 
 
 		 636 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  31.63 
 
 		 634 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  31.63 
 
 		 636 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  30 
 
 		 597 aa  258  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  27.98 
 
 		 660 aa  256  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  31.65 
 
 		 704 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  30.9 
 
 		 567 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  27.29 
 
 		 595 aa  249  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  28.57 
 
 		 642 aa  248  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  30.36 
 
 		 637 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  30.02 
 
 		 704 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  30.02 
 
 		 712 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  30.58 
 
 		 708 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  28.93 
 
 		 674 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  28.27 
 
 		 591 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  28.75 
 
 		 666 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  29.31 
 
 		 639 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  30.04 
 
 		 600 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  28.18 
 
 		 602 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  28.65 
 
 		 603 aa  225  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_004310  BR1490  transporter, putative  27.04 
 
 		 621 aa  224  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  27.26 
 
 		 534 aa  223  9e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  26.85 
 
 		 621 aa  221  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  29.04 
 
 		 589 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  29.15 
 
 		 626 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4936  ABC transporter  25.53 
 
 		 606 aa  219  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00595955  normal  0.404726 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  28.55 
 
 		 660 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>