219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0832 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0832  methylaspartate mutase subunit S  100 
 
 		 149 aa  299  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0752  methylaspartate mutase subunit S  99.33 
 
 		 149 aa  296  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4403  methylaspartate mutase subunit S  57.46 
 
 		 136 aa  167  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2692  methylaspartate mutase subunit S  62.71 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15460  methylaspartate mutase subunit S  57.04 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1347  methylaspartate mutase subunit S  53.73 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  54.47 
 
 		 139 aa  146  7e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1594  methylaspartate mutase, S subunit  43.17 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3334  methylaspartate mutase, S subunit  44.27 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2980  methylaspartate mutase subunit S  43.51 
 
 		 146 aa  116  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2791  methylaspartate mutase, S subunit  45.11 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4358  cobalamin B12-binding domain protein  31.54 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.554272  normal  0.47471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  37.23 
 
 		 730 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  27.41 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  31.43 
 
 		 1244 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1642  cobalamin B12-binding domain-containing protein  39.8 
 
 		 733 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3405  methylaspartate mutase, E subunit  30.28 
 
 		 646 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0202  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0222678  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  29.13 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  25.93 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0197  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.3 
 
 		 261 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  37.29 
 
 		 1156 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  26.09 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.47 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.52 
 
 		 734 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0909  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.23 
 
 		 728 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.9 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  30.58 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  27.91 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  26.81 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  26.42 
 
 		 1239 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  26.52 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1170  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  30.07 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.88369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  31.09 
 
 		 745 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.79 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  23.91 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6322  hypothetical protein  28.46 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  25.76 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  25.56 
 
 		 1245 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  37.36 
 
 		 236 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.74 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  28.04 
 
 		 1191 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.34 
 
 		 265 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  28.04 
 
 		 1191 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.29 
 
 		 1163 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  25.76 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  23.48 
 
 		 1271 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.46 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2612  methionine synthase  27.88 
 
 		 894 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  28.89 
 
 		 1168 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  25.18 
 
 		 1272 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  36.07 
 
 		 1197 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  34.43 
 
 		 1195 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2332  methylmalonyl-CoA mutase  26.98 
 
 		 1146 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3887  cobalamin B12-binding  31.17 
 
 		 251 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  34.43 
 
 		 804 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0112  B12-dependent methionine synthase  29.17 
 
 		 1259 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.937971  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  25.36 
 
 		 1286 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  36.07 
 
 		 1262 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  34.43 
 
 		 1181 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2467  methionine synthase  28.87 
 
 		 1261 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2951  methylaspartate mutase subunit S  32.76 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872778  normal  0.0119232 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  34.43 
 
 		 1176 aa  45.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  36.67 
 
 		 1251 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  29.25 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  31.25 
 
 		 1251 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.26 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  25 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  25.47 
 
 		 1226 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  34.43 
 
 		 1158 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1431  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.07 
 
 		 222 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  35 
 
 		 1264 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  35 
 
 		 1264 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  29.9 
 
 		 1266 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  23.65 
 
 		 1271 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  35 
 
 		 1220 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  27.18 
 
 		 1269 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  24.26 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2199  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.25 
 
 		 727 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.15 
 
 		 1208 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  33.87 
 
 		 841 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  32.26 
 
 		 800 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  32.79 
 
 		 1215 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  26.47 
 
 		 718 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  32.79 
 
 		 1216 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  24.82 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  31.15 
 
 		 1212 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  32.79 
 
 		 1173 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2137  methionine synthase  27.84 
 
 		 1245 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.39755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  29.03 
 
 		 819 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  25.76 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  27.18 
 
 		 1227 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  31.15 
 
 		 1178 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  29.03 
 
 		 841 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  27.18 
 
 		 1227 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  32.79 
 
 		 1169 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  29.17 
 
 		 207 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  29.17 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>