More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0326 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0326  LysR substrate binding domain protein  100 
 
 		 294 aa  607  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.457404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2118  LysR family transcriptional regulator  86.73 
 
 		 294 aa  539  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0716  transcriptional regulator, LysR family  78.57 
 
 		 294 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 297 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  45.49 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  45.85 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  43.39 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  44.52 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  42.12 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 295 aa  241  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 297 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 298 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 297 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  43.34 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  44.52 
 
 		 297 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  40.75 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4793  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 328 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  40.97 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6790  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 295 aa  225  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6827  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 297 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4225  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.795038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35490  LysR family transcriptional regulator protein  41.44 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.24 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4800  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 297 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4886  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5478  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5384  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1360  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6469  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0548858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  40.41 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 324 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1976  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  40.61 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3068  transcriptional regulator  41.36 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1541  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2296  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  39.93 
 
 		 304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01306  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.27 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.387264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2317  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.342284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1444  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01316  hypothetical protein  40.27 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 297 aa  215  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 297 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 297 aa  215  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1568  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0934  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1793  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5627  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6375  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.429031 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4885  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0654  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  41.44 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  41.44 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2045  transcriptional regulator, LysR family  43.49 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  39.04 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>