More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02648 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02648  L-fuculose phosphate aldolase  100 
 
 		 314 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02609  hypothetical protein  99.68 
 
 		 332 aa  652    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3916  transcriptional regulator, LacI family  56.09 
 
 		 334 aa  359  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0874  transcriptional regulator, LacI family  37.67 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2909  sucrose operon repressor  30.99 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00007545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4207  LacI family transcription regulator  29.43 
 
 		 347 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3759  transcriptional regulator, LacI family  29.33 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.899629  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3596  transcriptional regulator, LacI family  29 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000221  fructose repressor FruR LacI family  30.1 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2023  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 338 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  32.26 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  31.94 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0391  transcriptional regulator, LacI family  28.43 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.133972  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05957  DNA-binding transcriptional regulator FruR  29.39 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0347  transcriptional regulator, LacI family  28.09 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.427458  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0089  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.16 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.72 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  32.91 
 
 		 331 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0820  DNA-binding transcriptional regulator FruR  29.84 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  29.49 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2649  DNA-binding transcriptional regulator FruR  29.7 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0598  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.73 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0134  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.3 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.3 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0135  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.3 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  29.53 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.3 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000945493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0127  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.3 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0953  fructose repressor FruR, putative  29.75 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0452  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.47 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00081  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.85 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0086  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.85 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3520  transcriptional regulator, LacI family  28.16 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3577  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.85 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0088  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.85 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0073  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.85 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12180  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.72 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00080  hypothetical protein  27.85 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0082  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.85 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0085  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.85 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  31.54 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0626  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.67 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.800956  normal  0.256043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  31.54 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  31.54 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  31.51 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4401  DNA-binding transcriptional regulator FruR  31.18 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0636  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.27 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3550  DNA-binding transcriptional regulator FruR  31.25 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0750  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.58 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1220  transcriptional regulator, LacI family  30.1 
 
 		 376 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.485348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3791  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.48 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  28.23 
 
 		 353 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3603  DNA-binding transcriptional regulator FruR  27.24 
 
 		 334 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3399  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.96 
 
 		 336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3529  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.96 
 
 		 336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2929  DNA-binding transcriptional regulator FruR  26.96 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.91 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  28.11 
 
 		 337 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1892  transcriptional regulator, LacI family  25.71 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  27.24 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.57 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  26.73 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  26.48 
 
 		 340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  26 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  24.08 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  26.74 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13230  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.8 
 
 		 335 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.43 
 
 		 352 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4466  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 		 333 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  26.64 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  26.75 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2945  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.1 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.884709 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  26.15 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  28.43 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  28.38 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  27.96 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2710  regulatory protein, LacI  25.08 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  26.39 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  27.07 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  26.6 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  26.78 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  25.91 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  24.58 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  26.9 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  26.9 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0609  alanine racemase  27.59 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  26.33 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  26.79 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  27.4 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  28.67 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  26.06 
 
 		 358 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.44 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0058  LacI family transcription regulator  26.35 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  26.76 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1785  LacI family transcription regulator  26.9 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  26.76 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  26.76 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>