187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2851 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  100 
 
 
473 aa  964    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  65.49 
 
 
494 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  57.98 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.11 
 
 
452 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  46 
 
 
462 aa  435  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  50.45 
 
 
459 aa  434  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  49.66 
 
 
468 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  50.43 
 
 
469 aa  425  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  50.8 
 
 
450 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  46.54 
 
 
451 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  49.89 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  45.68 
 
 
495 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  47.37 
 
 
447 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  42.98 
 
 
506 aa  350  3e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.44 
 
 
466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.56 
 
 
448 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.9 
 
 
449 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  40.39 
 
 
464 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41733  predicted protein  40.22 
 
 
477 aa  293  5e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  normal  0.188048 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36787  predicted protein  40.22 
 
 
477 aa  293  5e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00684152  hitchhiker  0.00249943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  39.91 
 
 
468 aa  293  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51952  class II CPD photolyase  37.63 
 
 
511 aa  289  6e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3500  DNA photolyase FAD-binding protein  33.84 
 
 
453 aa  283  5.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0725  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.86 
 
 
455 aa  280  4e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6363  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.16 
 
 
465 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.65 
 
 
456 aa  273  6e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0155  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.77 
 
 
476 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4497  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  37.53 
 
 
446 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112755  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3762  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.22 
 
 
462 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12101  normal  0.44256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2754  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.85 
 
 
467 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.853539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2459  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.1 
 
 
467 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2531  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.42 
 
 
467 aa  253  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45715  predicted protein  37.04 
 
 
467 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.380145  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2716  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.99 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1430  DNA photolyase FAD-binding protein  34.18 
 
 
493 aa  234  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3125  DNA photolyase FAD-binding  38.11 
 
 
486 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3226  DNA photolyase FAD-binding  37.68 
 
 
486 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4973  DNA photolyase FAD-binding protein  36.03 
 
 
496 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3007  DNA photolyase FAD-binding  36.07 
 
 
493 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3028  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  37.23 
 
 
490 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  33.69 
 
 
843 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.3 
 
 
468 aa  80.5  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1907  DNA photolyase, class 2  38.95 
 
 
104 aa  77  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1615  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.19 
 
 
471 aa  73.2  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.49 
 
 
454 aa  72.4  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.1 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.19 
 
 
492 aa  70.5  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.82 
 
 
493 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.81 
 
 
490 aa  67.4  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.61 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.2 
 
 
511 aa  67  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.21 
 
 
469 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.28 
 
 
500 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.67 
 
 
499 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.59 
 
 
493 aa  63.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.84 
 
 
478 aa  63.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0237  deoxyribodipyrimidine photolyase-like  39.19 
 
 
114 aa  63.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.969227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.34 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.11 
 
 
493 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.56 
 
 
499 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.48 
 
 
486 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0776  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.36 
 
 
479 aa  60.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0436296  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0465  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.04 
 
 
473 aa  60.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.83 
 
 
481 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.5 
 
 
479 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.45 
 
 
505 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.1 
 
 
481 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.65 
 
 
475 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2844  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.25 
 
 
499 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758456  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2541  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.38 
 
 
466 aa  60.1  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.272644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4292  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.71 
 
 
479 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.03 
 
 
499 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.46 
 
 
482 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.74 
 
 
484 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.32 
 
 
453 aa  58.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.17 
 
 
497 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.55 
 
 
519 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.55 
 
 
519 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.86 
 
 
475 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.13 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00387  DNA photolyase (Eurofung)  25.19 
 
 
567 aa  58.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.892479  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.27 
 
 
477 aa  57  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.59 
 
 
471 aa  56.6  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  25.74 
 
 
476 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.41 
 
 
475 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.3 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.65 
 
 
488 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  27.96 
 
 
471 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  27.96 
 
 
471 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.68 
 
 
478 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49165  predicted protein  25.61 
 
 
495 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.57 
 
 
479 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.45 
 
 
463 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  26.57 
 
 
476 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.57 
 
 
476 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  27.41 
 
 
472 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.74 
 
 
483 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.34 
 
 
475 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  26.57 
 
 
476 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.65 
 
 
449 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>