238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2541 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2541  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 329 aa  653    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1563  uracil-DNA glycosylase  56.72 
 
 		 399 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0514  uracil-DNA glycosylase  53.36 
 
 		 233 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  49.11 
 
 		 222 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 221 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 		 219 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 221 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 221 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 221 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  49.08 
 
 		 221 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 		 221 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 		 227 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  44.96 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  46.43 
 
 		 224 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  45.61 
 
 		 223 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  48 
 
 		 221 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  47.53 
 
 		 218 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  45.29 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  45.74 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  47.95 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  46.19 
 
 		 219 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  45.78 
 
 		 221 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  46.19 
 
 		 219 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  47.53 
 
 		 226 aa  199  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  47.98 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  47.86 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  44.4 
 
 		 230 aa  197  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  47.77 
 
 		 229 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  49.07 
 
 		 228 aa  195  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  47.35 
 
 		 231 aa  196  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  44 
 
 		 235 aa  196  7e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  47.32 
 
 		 228 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  49.07 
 
 		 228 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  47.44 
 
 		 241 aa  195  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 229 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0224  uracil-DNA glycosylase  46.84 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 229 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  45.78 
 
 		 220 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 		 243 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  47.98 
 
 		 228 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  47.77 
 
 		 229 aa  193  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  42.31 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  47.98 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  47.77 
 
 		 229 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  47.77 
 
 		 229 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  47.98 
 
 		 228 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  46.3 
 
 		 255 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  45.54 
 
 		 226 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  46.33 
 
 		 222 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  47.09 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  48.87 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  40 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  42.13 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  46.46 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  47.09 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  41.37 
 
 		 232 aa  189  5e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  43.5 
 
 		 222 aa  189  7e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  46.43 
 
 		 229 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2887  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 		 266 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  46.43 
 
 		 229 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  46.43 
 
 		 229 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 		 256 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  39.43 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  43.4 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  46.43 
 
 		 229 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  46.43 
 
 		 229 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  45.23 
 
 		 232 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  47.25 
 
 		 261 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  41.18 
 
 		 225 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  44.05 
 
 		 221 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  43.93 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  45.11 
 
 		 218 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  42.68 
 
 		 231 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  44.21 
 
 		 231 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  45.78 
 
 		 229 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  42.31 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  47.2 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  47.39 
 
 		 229 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  43.3 
 
 		 222 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  43.8 
 
 		 231 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  44.4 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  41.53 
 
 		 220 aa  183  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  41.32 
 
 		 229 aa  183  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 226 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  44.4 
 
 		 259 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  44.4 
 
 		 259 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  44.4 
 
 		 259 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2764  uracil-DNA glycosylase  46.96 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  38.8 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  40.98 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  44.34 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3129  uracil-DNA glycosylase  46.96 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.532075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  46.23 
 
 		 230 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  46.61 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  42.52 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  43.81 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>