More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1267 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  72.09 
 
 		 87 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  74.42 
 
 		 87 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  63.22 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  58.14 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  52.87 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  52.87 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  55.17 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  47.13 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  44.71 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2717  30S ribosomal protein S20  51.9 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1517  SSU ribosomal protein S20P  44 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.256049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  42.53 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  45.35 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  42.5 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  46.99 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0947  ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.351712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1648  ribosomal protein S20  47.95 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 86 aa  57  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  45 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>