30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1025 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1025  nuclease  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0861238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  63.96 
 
 		 146 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  48.28 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  40.91 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  40 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  35 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1330  nuclease  37.82 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  33.85 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  45.45 
 
 		 88 aa  51.6  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  35.9 
 
 		 374 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  34.19 
 
 		 346 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  36.45 
 
 		 258 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  30.39 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  34.82 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  31.43 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45339  predicted protein  31.11 
 
 		 334 aa  45.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  36.97 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  35.11 
 
 		 237 aa  45.1  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  35.96 
 
 		 372 aa  44.7  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  33.98 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  33.05 
 
 		 350 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  32.41 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  35.78 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  27.64 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  35.71 
 
 		 168 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  29.25 
 
 		 408 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  32.46 
 
 		 186 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 143 aa  42  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  30.28 
 
 		 169 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>