More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0660 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 461 aa  922    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 469 aa  183  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  38.46 
 
 		 483 aa  173  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 452 aa  170  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 466 aa  170  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 470 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 477 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  28.26 
 
 		 486 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 469 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  34.11 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.57 
 
 		 446 aa  156  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 469 aa  156  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  38.1 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  33.33 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  37.88 
 
 		 593 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 469 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 463 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 463 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  33.24 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  36.96 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 477 aa  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  34.1 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 641 aa  150  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  33.02 
 
 		 475 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 467 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 463 aa  149  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 467 aa  149  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 389 aa  149  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  34.52 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  31.19 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  28.53 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 815 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  33.96 
 
 		 469 aa  147  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 464 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  35 
 
 		 476 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 639 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 450 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 585 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  35.77 
 
 		 476 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 509 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  36.08 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  32.56 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  35.87 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  33.11 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  33.11 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  33.11 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  33.11 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.81 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  33.11 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  34.19 
 
 		 468 aa  144  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  33.11 
 
 		 480 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 524 aa  143  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 462 aa  143  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 456 aa  143  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 640 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  35.89 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 589 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>