296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0132 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0132  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
979 aa  1890    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.807661  normal  0.0603201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0547  ComEC/Rec2-related protein  38.7 
 
 
900 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2450  ComEC/Rec2-related protein  43.03 
 
 
1100 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1806  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.66 
 
 
804 aa  352  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1798  ComEC/Rec2-related protein  47.08 
 
 
937 aa  235  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0764  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.5 
 
 
811 aa  205  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.804759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.68 
 
 
840 aa  149  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.89 
 
 
759 aa  146  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.94 
 
 
761 aa  143  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.96 
 
 
773 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0899  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.27 
 
 
798 aa  133  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383263  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  35.74 
 
 
348 aa  127  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.95 
 
 
851 aa  127  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1556  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.01 
 
 
774 aa  127  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.86 
 
 
841 aa  126  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.81 
 
 
814 aa  125  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.29 
 
 
757 aa  125  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.73 
 
 
846 aa  125  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.04 
 
 
809 aa  124  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  32.81 
 
 
390 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  36.18 
 
 
479 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.91 
 
 
840 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.12 
 
 
839 aa  120  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.55 
 
 
798 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  30.91 
 
 
872 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 
367 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  30.95 
 
 
502 aa  119  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.62 
 
 
868 aa  118  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
294 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.74 
 
 
794 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.66 
 
 
778 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.48 
 
 
845 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  34.87 
 
 
846 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  31.54 
 
 
300 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
300 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  31.8 
 
 
300 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  31.8 
 
 
300 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  31.8 
 
 
300 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  31.8 
 
 
300 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  31.8 
 
 
300 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  35.97 
 
 
451 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.27 
 
 
773 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  31.38 
 
 
300 aa  110  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.55 
 
 
785 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.71 
 
 
839 aa  110  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  35.56 
 
 
825 aa  109  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.56 
 
 
822 aa  109  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1902  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.9 
 
 
880 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  30.42 
 
 
300 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.01 
 
 
770 aa  109  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 
300 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.18 
 
 
797 aa  109  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.1 
 
 
808 aa  108  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  30.54 
 
 
300 aa  108  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  29.48 
 
 
461 aa  108  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.87 
 
 
878 aa  108  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  29.09 
 
 
773 aa  108  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.25 
 
 
784 aa  108  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.08 
 
 
749 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  31.15 
 
 
291 aa  107  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  29.18 
 
 
443 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.03 
 
 
773 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  29.88 
 
 
461 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.17 
 
 
789 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 
320 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  30.74 
 
 
292 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2389  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.67 
 
 
831 aa  107  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00142105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.08 
 
 
750 aa  107  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.23 
 
 
771 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.03 
 
 
773 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  29.48 
 
 
461 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 
284 aa  106  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01534  hypothetical protein  26.01 
 
 
752 aa  105  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  30.2 
 
 
461 aa  105  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  30.4 
 
 
735 aa  105  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  24.46 
 
 
795 aa  105  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  30.2 
 
 
461 aa  105  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5966  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.41 
 
 
829 aa  105  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2111  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.41 
 
 
829 aa  105  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.261797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.36 
 
 
654 aa  104  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.28 
 
 
802 aa  104  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.1 
 
 
773 aa  104  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.36 
 
 
773 aa  104  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003988  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  30.5 
 
 
752 aa  104  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 
352 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2129  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.01 
 
 
829 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326593  normal  0.0900672 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  30 
 
 
735 aa  104  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2200  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.88 
 
 
873 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.62 
 
 
800 aa  103  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.17 
 
 
812 aa  103  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1779  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.47 
 
 
762 aa  102  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2827  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.17 
 
 
767 aa  102  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0829289 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 
318 aa  102  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1159  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.6 
 
 
819 aa  101  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1336  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.31 
 
 
765 aa  101  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2715  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.46 
 
 
842 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.78 
 
 
840 aa  101  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.54 
 
 
772 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2423  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.73 
 
 
773 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.2 
 
 
860 aa  100  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>