50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1464 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  87.69 
 
 
390 aa  738    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  77.38 
 
 
421 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  100 
 
 
390 aa  803    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  72.42 
 
 
390 aa  594  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  69.09 
 
 
388 aa  578  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  60.41 
 
 
403 aa  472  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  59.69 
 
 
407 aa  450  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  56.62 
 
 
412 aa  443  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  55.44 
 
 
399 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  53.87 
 
 
423 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  53.93 
 
 
406 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  55.99 
 
 
405 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  55.47 
 
 
408 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  54.69 
 
 
408 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  53.39 
 
 
408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  51.44 
 
 
500 aa  386  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  51.43 
 
 
500 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  49.61 
 
 
503 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  49.87 
 
 
513 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  47.87 
 
 
511 aa  369  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  48.61 
 
 
513 aa  368  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  49.37 
 
 
513 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  48.95 
 
 
438 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  48.37 
 
 
513 aa  355  5e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  47.93 
 
 
389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  47.79 
 
 
384 aa  348  8e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  47.33 
 
 
403 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  47.51 
 
 
455 aa  344  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  47.35 
 
 
502 aa  344  2e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  47.92 
 
 
502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  46.63 
 
 
390 aa  339  4e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  46.58 
 
 
404 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  46.33 
 
 
404 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  45.88 
 
 
389 aa  335  9e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  46.53 
 
 
502 aa  333  4e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  45.29 
 
 
503 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  45.26 
 
 
502 aa  330  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  43.83 
 
 
434 aa  310  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  33.23 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  32.7 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  29.01 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  28.41 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  27.81 
 
 
427 aa  126  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  28.95 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  29.97 
 
 
408 aa  119  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  28.16 
 
 
410 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  26.4 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  26 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  26.07 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  25.17 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>