296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0830 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0830  HI0933 family protein  100 
 
 		 419 aa  843    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  59.56 
 
 		 389 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  52.8 
 
 		 391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  40.77 
 
 		 401 aa  334  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  41.39 
 
 		 392 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  39.86 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  43.3 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  41.15 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  42.55 
 
 		 394 aa  328  9e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1308  HI0933 family protein  44.05 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0313133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  40.05 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  42.89 
 
 		 394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  42.32 
 
 		 398 aa  325  9e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  44.12 
 
 		 396 aa  319  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  39.95 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  41.97 
 
 		 394 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  42.24 
 
 		 394 aa  316  6e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  44.47 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  40.77 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  41.83 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  44.98 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  41.87 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  41.59 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  42.65 
 
 		 397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  41.59 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  41.49 
 
 		 394 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  40.88 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  41.27 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  42.82 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  42.55 
 
 		 406 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  41.35 
 
 		 394 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  41.63 
 
 		 393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  41.01 
 
 		 393 aa  308  9e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  43.97 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  38.86 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  44.26 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  40.48 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  40.57 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  39.1 
 
 		 393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  41.39 
 
 		 393 aa  306  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  40.05 
 
 		 392 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  40.33 
 
 		 397 aa  307  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  41.35 
 
 		 398 aa  306  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  41.11 
 
 		 394 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  37.5 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  41.41 
 
 		 414 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  40.67 
 
 		 392 aa  306  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  38.03 
 
 		 405 aa  305  9.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  41.87 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  41.05 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  41.29 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  41.49 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  43.59 
 
 		 413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  43.59 
 
 		 413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  41.05 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  43.54 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  40 
 
 		 393 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  43.54 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  41.25 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  42.42 
 
 		 406 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  38.28 
 
 		 393 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0137  hypothetical protein  40.43 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  37.78 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  40.77 
 
 		 396 aa  298  8e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  41.25 
 
 		 398 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  39.52 
 
 		 399 aa  298  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  41.25 
 
 		 398 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  41.49 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  41.49 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  41.49 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2439  hypothetical protein  41.93 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  37.5 
 
 		 393 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  40.33 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4817  hypothetical protein  42.07 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  41.83 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  38.94 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  40.44 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  38.12 
 
 		 392 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  41.55 
 
 		 415 aa  295  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  39.81 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  41.87 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  41.63 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3645  hypothetical protein  41.93 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  41.93 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  41.93 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.151985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  39.23 
 
 		 394 aa  293  6e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  41.25 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  40 
 
 		 399 aa  292  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  41.13 
 
 		 400 aa  292  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  41.13 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2710  hypothetical protein  41.9 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3779  hypothetical protein  42.17 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.0295291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3539  HI0933 family protein  42.48 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110532  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  40.89 
 
 		 400 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  41.71 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  38.67 
 
 		 393 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  40.89 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  40.89 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  38.67 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3253  hypothetical protein  41.93 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0198176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>