More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0373 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0373  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
159 aa  317  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1422  3-dehydroquinate dehydratase  77.7 
 
 
155 aa  247  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216842  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1952  3-dehydroquinate dehydratase  73.2 
 
 
154 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000216086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2481  3-dehydroquinate dehydratase  70 
 
 
149 aa  200  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1300  3-dehydroquinate dehydratase  62.25 
 
 
150 aa  187  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0501246  normal  0.27707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  47.71 
 
 
172 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.03 
 
 
144 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 
149 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 
149 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.52 
 
 
145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.98 
 
 
145 aa  130  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  45.03 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 
148 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.94 
 
 
147 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  38.51 
 
 
147 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  45.07 
 
 
150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
151 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
207 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
207 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.39 
 
 
138 aa  127  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
154 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  38.51 
 
 
147 aa  127  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 
145 aa  127  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  44.93 
 
 
151 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  38.26 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
141 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
151 aa  124  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
150 aa  124  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 
149 aa  124  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  48.37 
 
 
162 aa  124  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 
150 aa  124  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.3 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 
149 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  44.52 
 
 
153 aa  123  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
153 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  44.29 
 
 
159 aa  122  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  48 
 
 
149 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
153 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 
148 aa  123  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  43.54 
 
 
145 aa  123  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
149 aa  123  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
147 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
150 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  46.05 
 
 
160 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.55 
 
 
137 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
150 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  48 
 
 
151 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 
145 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
150 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
150 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 
155 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
150 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  45.03 
 
 
151 aa  121  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  42.47 
 
 
160 aa  121  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 
155 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
158 aa  121  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  48.67 
 
 
149 aa  120  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  40.71 
 
 
159 aa  120  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 
141 aa  120  8e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  44.74 
 
 
150 aa  120  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  44.97 
 
 
156 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  46.75 
 
 
162 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.52 
 
 
139 aa  120  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  43.48 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  43.48 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  45.32 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  44.3 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  45.07 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  47.33 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  40.97 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 
148 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  41.84 
 
 
159 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  46.05 
 
 
151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.68 
 
 
150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  44.68 
 
 
150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  46.26 
 
 
151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>