More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0935 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  524  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  54.76 
 
 
264 aa  290  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  56.4 
 
 
256 aa  290  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  55.56 
 
 
265 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  57.87 
 
 
255 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  54.9 
 
 
255 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  52.92 
 
 
284 aa  285  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  55.16 
 
 
256 aa  284  8e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  55.65 
 
 
270 aa  284  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  52.92 
 
 
284 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  55.65 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  53.2 
 
 
270 aa  282  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  55.02 
 
 
263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  55.69 
 
 
270 aa  281  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  50.99 
 
 
255 aa  280  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 
254 aa  280  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  53.78 
 
 
259 aa  278  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
259 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  54 
 
 
271 aa  277  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  53.75 
 
 
255 aa  275  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  52.17 
 
 
273 aa  275  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  51.97 
 
 
255 aa  274  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  52.57 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  53.57 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  52.99 
 
 
286 aa  271  6e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  52.78 
 
 
261 aa  271  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  54.98 
 
 
259 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  57.03 
 
 
264 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  52.59 
 
 
288 aa  270  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  54.37 
 
 
252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  52.59 
 
 
263 aa  269  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  50 
 
 
259 aa  269  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  52.38 
 
 
273 aa  268  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  52.61 
 
 
271 aa  268  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  51.61 
 
 
271 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  54.12 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  52 
 
 
271 aa  263  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  47.2 
 
 
302 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  52.57 
 
 
256 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  51.38 
 
 
255 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  51.81 
 
 
283 aa  261  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  49.21 
 
 
255 aa  261  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  51.55 
 
 
261 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  47.55 
 
 
307 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  50.79 
 
 
255 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  51.01 
 
 
268 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  51.41 
 
 
276 aa  259  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  51.41 
 
 
258 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  50.6 
 
 
252 aa  259  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  51.81 
 
 
275 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  51.39 
 
 
256 aa  260  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  51.81 
 
 
275 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  51.81 
 
 
275 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 
254 aa  259  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  53.41 
 
 
261 aa  258  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  51.39 
 
 
257 aa  257  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  51.41 
 
 
293 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  49.8 
 
 
255 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  50 
 
 
255 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  51.56 
 
 
264 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  54.18 
 
 
254 aa  255  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  51.17 
 
 
262 aa  255  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  50.19 
 
 
262 aa  254  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  48.8 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  51.19 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  50 
 
 
270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  50.59 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  51 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  51 
 
 
257 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  51.38 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  51.81 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  50.6 
 
 
265 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  50.6 
 
 
265 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  51.39 
 
 
256 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  49.8 
 
 
333 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  50.59 
 
 
261 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  50.2 
 
 
280 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 
255 aa  249  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  52.23 
 
 
271 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 
255 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
256 aa  249  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  51.59 
 
 
260 aa  249  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 
256 aa  249  3e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  49.41 
 
 
281 aa  249  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  51 
 
 
258 aa  248  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  49.21 
 
 
256 aa  248  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.81 
 
 
261 aa  248  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  50.6 
 
 
258 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.81 
 
 
257 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 
257 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 
257 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.81 
 
 
257 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 
257 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 
257 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  49.4 
 
 
252 aa  245  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 
257 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.836649 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.02 
 
 
257 aa  245  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.2 
 
 
251 aa  245  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.6 
 
 
258 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>