107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0563 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 396 aa  798    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  54.09 
 
 		 646 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  48.59 
 
 		 442 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  57.37 
 
 		 442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  57.38 
 
 		 272 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  57.38 
 
 		 272 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  51.33 
 
 		 1635 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  50 
 
 		 436 aa  253  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  42.34 
 
 		 306 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  30.15 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  41.33 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  41.99 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  31.49 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  41.01 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1085 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00750  hypothetical protein  32.34 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 995 aa  63.9  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.88 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  33.66 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 239 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 259 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 222 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 208 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  36.89 
 
 		 249 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  29.14 
 
 		 274 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 233 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 226 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  28.45 
 
 		 185 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 295 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 200 aa  49.7  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 214 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  31.37 
 
 		 488 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  35.92 
 
 		 245 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.17 
 
 		 303 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 237 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  27.07 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 210 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 256 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 256 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  30.41 
 
 		 211 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 257 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  30.69 
 
 		 199 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  27.56 
 
 		 234 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 243 aa  46.6  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  34 
 
 		 449 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  26.37 
 
 		 264 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  27.13 
 
 		 303 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1544  Generic methyltransferase  29.8 
 
 		 201 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  36.59 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  25.58 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  25.58 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  33.93 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  28.44 
 
 		 233 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 196 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 218 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.43 
 
 		 291 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.62 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  33 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 242 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  25.58 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.33 
 
 		 672 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  39.06 
 
 		 201 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 248 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 214 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.77 
 
 		 200 aa  43.9  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  28.12 
 
 		 227 aa  43.5  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 266 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  31 
 
 		 201 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.71 
 
 		 257 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 209 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.7 
 
 		 296 aa  43.9  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  26.23 
 
 		 231 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41621  predicted protein  28.91 
 
 		 246 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0117429 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36712  predicted protein  28.91 
 
 		 246 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.214896  hitchhiker  0.00091812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2211  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  28.46 
 
 		 235 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210653  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  29.8 
 
 		 258 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 244 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  31 
 
 		 450 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 248 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  26.05 
 
 		 358 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>