47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3251 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3251  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  354  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1039  hypothetical protein  31.48 
 
 		 176 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0955  hypothetical protein  32.56 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0372  pilus assembly protein, PilO  24.26 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.116717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0283  type IV pilus biogenesis protein PilO  28.67 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3897  pilus assembly protein, PilO  27.84 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000635484  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3405  pilus assembly protein PilO  25 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.152027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3709  pilus assembly protein, PilO  27.84 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00761204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0235  pilus assembly protein PilO  22.02 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.613869  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0258  pilus assembly protein, PilO  27.16 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3701  pilus assembly protein, PilO  26.8 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0244  pilus assembly protein, PilO  26.8 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4087  pilus assembly protein PilO  27.16 
 
 		 207 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4205  pilus assembly protein PilO  27.16 
 
 		 207 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4116  pilus assembly protein PilO  27.16 
 
 		 207 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4006  Pilus assembly protein PilO  27.16 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0160  type IV pilus biogenesis protein PilO  30.93 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.546604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0407  pilus assembly protein, PilO  27.97 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0292492  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2904  Pilus assembly protein PilO  25.44 
 
 		 219 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4268  pilus assembly protein, PilO  23.27 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.449559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0669  pilus assembly protein, PilO  27.03 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.823764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0337  pilus assembly protein PilO  25.84 
 
 		 205 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0210  pilus assembly protein, PilO  27.06 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216288  hitchhiker  0.0081665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66640  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  25.26 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  27.72 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45280  Pilus assembly protein  26.85 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1939  Pilus assembly protein PilO  24.65 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3371  type IV pilus biogenesis protein PilO  23.42 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  24.73 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3251  Pilus assembly protein PilO  24.69 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0544  pilus assembly protein, PilO  25.74 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2921  pilus assembly protein, PilO  20.23 
 
 		 223 aa  45.1  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0732  pilus assembly protein, PilO  21.71 
 
 		 224 aa  44.7  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2973  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  26.04 
 
 		 221 aa  44.3  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0701  Pilus assembly protein PilO  21.71 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0469  type IV pilus biogenesis protein PilO  22.62 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00513  type IV pilus biogenesis protein PilO  23.28 
 
 		 203 aa  44.3  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0994  pilus assembly protein, PilO  25.16 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5130  type IV pilus biogenesis protein PilO  23.66 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.818389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5579  pilus assembly protein PilO  24.35 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  23.71 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2209  putative fimbrial assembly protein PilO  25 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00186051  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0331  pilus assembly protein PilO  21.67 
 
 		 211 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0217389  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2030  type IV pilus biogenesis protein PilO  24.43 
 
 		 198 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.72092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002324  type IV pilus biogenesis protein PilO  20.34 
 
 		 197 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0836  Pilus assembly protein PilO  30.68 
 
 		 224 aa  41.2  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0674  pilus assembly protein, PilO  24.56 
 
 		 224 aa  40.8  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.214156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>