60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3138 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3138  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.766563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  29.41 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  29.41 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  28.95 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  25.21 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.98 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 		 423 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  26.42 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  37.84 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  26.87 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  39.73 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 263 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  22.12 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 325 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  23.78 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  29.55 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  43.33 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  38.96 
 
 		 305 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  45.65 
 
 		 400 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  19.21 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  34.15 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  22.36 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  30.38 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  43.33 
 
 		 344 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 		 333 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  24.04 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  32.76 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 290 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 		 262 aa  42  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 421 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 352 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 271 aa  42  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  39.66 
 
 		 271 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>