244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2910 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2910  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44801  normal  0.495918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1262  Hly-III family protein  50.47 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0525  hypothetical protein  48.11 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2177  Hly-III family protein  48.11 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00438954  normal  0.0630884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0547  Hly-III related proteins  42.27 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0605  Hly-III family protein  40.58 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  35.94 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  34.6 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  34.6 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  34.6 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  34.6 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  34.6 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  34.6 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  34.6 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  34.6 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  34.6 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  36.79 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0904  Hly-III family protein  44 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0661  Hly-III related proteins  39.13 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5366  Hly-III family protein  37.22 
 
 		 230 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0078  Hly-III family protein  39.23 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  35.19 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  28.57 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  38.57 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0068  hemolysin III family channel protein  38.97 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  33.81 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  36.32 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0067  hemolysin III family channel protein  38.97 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  35.85 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  36.89 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  34.6 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  34.6 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  34.6 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  34.6 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0867  Hly-III family protein  35.81 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296032  normal  0.935947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0995  Hly-III family protein  36.28 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  36.28 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  36.49 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  34.45 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  34.12 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  36.89 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  36.59 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  34.55 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  35.71 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  30.62 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  32.23 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  32.37 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1773  Hly-III family protein  36.27 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  31.78 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  36.41 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3940  Hly-III related proteins  35.96 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  36.63 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3388  Hly-III related proteins  36.76 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0217913  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  32.7 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  33.95 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1271  Hemolysin III  38.35 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  35.58 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3701  Hly-III related proteins  34.98 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  38.05 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  36.1 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5862  Hly-III family protein  37.33 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  39.05 
 
 		 249 aa  99  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  33.33 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  32.85 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  30.14 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  33.33 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  33.49 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  33.33 
 
 		 239 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  34.27 
 
 		 259 aa  94.7  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  33.97 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  33.49 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  33.49 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  33.49 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  33.97 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  33.49 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  33.49 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  38.35 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  37.42 
 
 		 224 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  37.86 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  35.19 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6673  hemolysin III  35.29 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1608  Hly-III family protein  31.6 
 
 		 226 aa  92  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  0.167379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  33.49 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  33.01 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  32.21 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1889  Hly-III family protein  31.6 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.582334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4269  Hly-III related proteins  33.5 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673544  normal  0.633803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  30.58 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  31.25 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  29.88 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1631  Hly-III family protein  33 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  37.35 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  26.44 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0520  hemolysin like protein  30.99 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0531  hemolysin III  33.01 
 
 		 214 aa  88.6  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.666008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2447  hemolysin III family channel protein  34.42 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  39.87 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  32.73 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  25.47 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>