98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2429 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  100 
 
 		 461 aa  920    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  58.76 
 
 		 456 aa  525  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  54.03 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  51.77 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  49.45 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  47.72 
 
 		 468 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  50.35 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  39.86 
 
 		 483 aa  242  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  40.34 
 
 		 515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  36.89 
 
 		 475 aa  213  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  34.56 
 
 		 493 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  30.17 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  29.96 
 
 		 460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  27.02 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  26.36 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  28.34 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  27.41 
 
 		 474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  27.64 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  25 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  25 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  25 
 
 		 472 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  25 
 
 		 472 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  25 
 
 		 472 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  25 
 
 		 472 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  25 
 
 		 482 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  25 
 
 		 472 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  27.24 
 
 		 473 aa  67  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  24.45 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  24.45 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  26.99 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  24.45 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  24.45 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  24.45 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  27.35 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  27.36 
 
 		 509 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3506  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.98 
 
 		 509 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  27.64 
 
 		 495 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  27.78 
 
 		 480 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  28.48 
 
 		 472 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  25.9 
 
 		 477 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  25.97 
 
 		 509 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  25.73 
 
 		 485 aa  53.9  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  27.37 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.68 
 
 		 509 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  24.3 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.29 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  25.72 
 
 		 499 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  30.28 
 
 		 515 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  28.05 
 
 		 508 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2076  carbohydrate kinase, FGGY  41.44 
 
 		 500 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00125408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  28.47 
 
 		 499 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  26.22 
 
 		 506 aa  50.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  28.07 
 
 		 477 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.24 
 
 		 501 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  27.16 
 
 		 508 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.2 
 
 		 530 aa  50.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  22.38 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  28.79 
 
 		 516 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  30.52 
 
 		 511 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  27.46 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  24.28 
 
 		 499 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  24.11 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  28.83 
 
 		 481 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0150  gluconate kinase  27.74 
 
 		 427 aa  47  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.731797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  28.46 
 
 		 474 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  27.68 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  28.46 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  22.78 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  24.9 
 
 		 515 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  24.89 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  26.72 
 
 		 515 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  30.99 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  26.32 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.3 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  30.57 
 
 		 523 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3072  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  27.4 
 
 		 556 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.317516  normal  0.334528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  26.32 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  26.32 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  26.32 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1866  carbohydrate kinase FGGY  29.84 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  26.32 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  25.61 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  25.31 
 
 		 498 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  27.16 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  22.56 
 
 		 513 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  26.64 
 
 		 502 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  22.58 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  22.48 
 
 		 505 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  21.65 
 
 		 519 aa  43.5  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1605  carbohydrate kinase FGGY  28.81 
 
 		 490 aa  43.5  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  23.67 
 
 		 489 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  22.34 
 
 		 499 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  21.9 
 
 		 494 aa  43.5  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  28.09 
 
 		 474 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  28.95 
 
 		 510 aa  43.5  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  23.32 
 
 		 499 aa  43.5  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  24.82 
 
 		 518 aa  43.1  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  24.02 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>