More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0977 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
336 aa  673    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  45.9 
 
 
351 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2512  glycosyl transferase family 9  45.23 
 
 
335 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.122114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  43.7 
 
 
341 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  42.32 
 
 
388 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  25.15 
 
 
315 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  30.2 
 
 
357 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.78 
 
 
516 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  34.97 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
361 aa  96.3  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  33.12 
 
 
344 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  26.65 
 
 
335 aa  92  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.86 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.86 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
367 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  30.17 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  22.8 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.07 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.99 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0668  glycosyl transferase family 9  25.76 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000239845  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.07 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  26.55 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  32.47 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.79 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.07 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.71 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  28.28 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.07 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  34.38 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.14 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  34.44 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  38.32 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  26.07 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  26.4 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  26.16 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.24 
 
 
779 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  31.14 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 
324 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.54 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  25.4 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.2 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  26.4 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4826  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  29.73 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290967  hitchhiker  0.000199841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.33 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1430  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.25 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  25.07 
 
 
332 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1155  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase, putative  25.17 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4509  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.87 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.65 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.07 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.83 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.48 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1722  glycosyl transferase family 9  23.96 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.51 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.57 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.85 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.45 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.85 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5747  heptosyltransferase II  29.76 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.85 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  23.6 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  26.4 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  24.13 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  26.4 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  38.03 
 
 
402 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.21 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.31 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4370  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.4 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.74 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.86 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  35.98 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  23.92 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  27.3 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4735  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  25 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  25.94 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.49 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  28.74 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  37.5 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  32.68 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.41 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.79 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.89 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.6 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.6 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.97 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  25.43 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.98 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  22.53 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.6 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.6 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.39 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.39 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>