45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1747 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 198 aa  410  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  47.69 
 
 		 457 aa  188  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  47.89 
 
 		 464 aa  185  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  45.79 
 
 		 210 aa  184  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  48.44 
 
 		 462 aa  184  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  45.92 
 
 		 461 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  48.44 
 
 		 197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  44.1 
 
 		 606 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  44.62 
 
 		 462 aa  174  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  44.56 
 
 		 458 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  43.01 
 
 		 458 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  45.6 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  40.93 
 
 		 454 aa  155  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  41.15 
 
 		 459 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  44.33 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  42.86 
 
 		 215 aa  140  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  38.02 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  38.07 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  39.15 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  40 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  41.03 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  37.56 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  37.37 
 
 		 225 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  36.41 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  38.62 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  40.51 
 
 		 213 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  38.62 
 
 		 262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  38.62 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  38.1 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 235 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.39 
 
 		 308 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29673  predicted protein  27.33 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00157248 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47894  predicted protein  24.53 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27237  predicted protein  27.33 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.3 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  30.58 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.57 
 
 		 351 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 423 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 		 359 aa  42  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>