60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0733 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 423 aa  873    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  64.2 
 
 		 426 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  59.91 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  60.81 
 
 		 426 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  58.25 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  55.17 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  46.93 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  44.03 
 
 		 440 aa  353  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  42.51 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  42.24 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  40.8 
 
 		 445 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  40.09 
 
 		 443 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  39.81 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  40.33 
 
 		 441 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  39.86 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  39.29 
 
 		 444 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  39.9 
 
 		 440 aa  302  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  42.07 
 
 		 421 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  37.62 
 
 		 418 aa  285  9e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  38.69 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  37.3 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  37.18 
 
 		 446 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  37 
 
 		 446 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  37.62 
 
 		 444 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  27.54 
 
 		 215 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.12 
 
 		 348 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 310 aa  50.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.83 
 
 		 319 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.6 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.69 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 287 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  21.14 
 
 		 287 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 317 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 360 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 		 300 aa  47.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.69 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 347 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1426  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.18 
 
 		 322 aa  47  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.16 
 
 		 326 aa  46.6  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 332 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.12 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.32 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.63 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  24.41 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  26.14 
 
 		 206 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  27.14 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.13 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.623593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.32 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.23 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.33 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1941  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.28 
 
 		 333 aa  43.5  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.89 
 
 		 337 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.89 
 
 		 337 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.89 
 
 		 337 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.29 
 
 		 317 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.89 
 
 		 337 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>