53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0047 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 426 aa  882    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  64.2 
 
 		 423 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  61.12 
 
 		 491 aa  544  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  60.57 
 
 		 426 aa  521  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  58.53 
 
 		 511 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  53.01 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  46.93 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  46.23 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  42.14 
 
 		 431 aa  348  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  42.92 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  41.71 
 
 		 443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  41.01 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  41.69 
 
 		 445 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  41.67 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  41.51 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  40.6 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  40.18 
 
 		 440 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 		 418 aa  288  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  39.47 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  40 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  39.67 
 
 		 446 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  39.67 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  40.84 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.61 
 
 		 348 aa  51.6  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.45 
 
 		 341 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  24.69 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.59 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.49 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.01 
 
 		 339 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 		 351 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  21.78 
 
 		 269 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  23.47 
 
 		 358 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4843  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.01 
 
 		 337 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  25.4 
 
 		 313 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.79 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 364 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.51 
 
 		 329 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  24.34 
 
 		 206 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 		 337 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 335 aa  43.5  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.33 
 
 		 337 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0399  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 		 337 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.33 
 
 		 337 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.33 
 
 		 337 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  29.08 
 
 		 351 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 320 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.33 
 
 		 337 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>