41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2996 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  73.35 
 
 		 441 aa  705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  73.18 
 
 		 443 aa  699    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  75.34 
 
 		 440 aa  708    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  73.18 
 
 		 441 aa  698    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  73.53 
 
 		 445 aa  700    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 444 aa  922    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  73.12 
 
 		 441 aa  698    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  61.52 
 
 		 443 aa  548  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  50.7 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  43.95 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  40.38 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  41.94 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  41.67 
 
 		 446 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  41.71 
 
 		 446 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 		 418 aa  319  7e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  40.6 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  40.14 
 
 		 421 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  40.47 
 
 		 491 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  41.92 
 
 		 427 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  39.29 
 
 		 423 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.77 
 
 		 426 aa  295  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  39.53 
 
 		 511 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  38.57 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  31.21 
 
 		 215 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  30.18 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.32 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.34 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 275 aa  47  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.95 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1056  Radical SAM domain protein  25.12 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  26.24 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.29 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  34.65 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2214  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.53 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.422159  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 336 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  25.47 
 
 		 335 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 332 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  25.44 
 
 		 354 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 335 aa  43.5  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>