70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2171 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
427 aa  858    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  51.31 
 
 
421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  43.17 
 
 
418 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  42.92 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  43.46 
 
 
441 aa  335  9e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  43.03 
 
 
441 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  43.68 
 
 
443 aa  332  6e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  41.37 
 
 
441 aa  326  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  40.66 
 
 
443 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  43.36 
 
 
440 aa  325  9e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  41.92 
 
 
444 aa  319  7.999999999999999e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  41.19 
 
 
443 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  44.47 
 
 
491 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  44.21 
 
 
511 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.38 
 
 
426 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  42.56 
 
 
440 aa  279  7e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  38.92 
 
 
426 aa  277  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  37.32 
 
 
431 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  38.69 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  42.42 
 
 
446 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  42.07 
 
 
446 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  42.07 
 
 
446 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  40.92 
 
 
444 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  40.23 
 
 
481 aa  236  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.16 
 
 
333 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.23 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.92 
 
 
349 aa  53.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 
337 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  28.51 
 
 
304 aa  51.2  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.71 
 
 
323 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1426  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.15 
 
 
322 aa  49.7  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
332 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 
300 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 
265 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.73 
 
 
326 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.49 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  33.33 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.32 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.97 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.74 
 
 
348 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.09 
 
 
337 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.09 
 
 
337 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.09 
 
 
337 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.09 
 
 
337 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.59 
 
 
332 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.76 
 
 
329 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 
360 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1941  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.83 
 
 
333 aa  47.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.47 
 
 
323 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  24.74 
 
 
310 aa  46.6  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.25 
 
 
325 aa  46.6  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2214  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.21 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.422159  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.16 
 
 
338 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117672 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.7 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.03 
 
 
347 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1410  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.07 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438576  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 
335 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.32 
 
 
332 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.42 
 
 
322 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.7 
 
 
298 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.34 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.37 
 
 
317 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
358 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.18 
 
 
298 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.06 
 
 
366 aa  43.5  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.65 
 
 
337 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  25.44 
 
 
353 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1947  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.19 
 
 
329 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.386779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>