135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1766 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
443 aa  907    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  50.94 
 
 
444 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  51.9 
 
 
440 aa  425  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  47.42 
 
 
431 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  49.64 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  49.17 
 
 
441 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  49.17 
 
 
441 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  47.75 
 
 
445 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  46.82 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  47.26 
 
 
443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  46.93 
 
 
426 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  49.53 
 
 
491 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 
443 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  46.93 
 
 
423 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  48.36 
 
 
426 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  48.35 
 
 
511 aa  348  9e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  45.92 
 
 
481 aa  329  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  42.07 
 
 
421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  41.55 
 
 
427 aa  285  9e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  40.84 
 
 
446 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  36.56 
 
 
418 aa  282  9e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  40.75 
 
 
446 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  40.75 
 
 
446 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  39.67 
 
 
444 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.31 
 
 
341 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.86 
 
 
366 aa  54.3  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.24 
 
 
322 aa  53.1  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2814  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 
299 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0943  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 
287 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.61 
 
 
340 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.68 
 
 
535 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  26.23 
 
 
531 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
319 aa  50.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.86 
 
 
531 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 
296 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.55 
 
 
423 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3584  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.49 
 
 
338 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3363  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.49 
 
 
338 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3627  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.49 
 
 
338 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.49 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.49 
 
 
338 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.589823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.49 
 
 
338 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.57 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0300  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  26.09 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3677  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.49 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1640  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.49 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3594  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.49 
 
 
338 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  26.09 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1410  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.78 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438576  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.75 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0881  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.22 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659843  hitchhiker  0.00030609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  23.76 
 
 
503 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.56 
 
 
326 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  29.87 
 
 
215 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1235  radical SAM family protein  30.67 
 
 
470 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.18 
 
 
345 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 
351 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 
299 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.41 
 
 
344 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 
287 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 
337 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0149  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
285 aa  47.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.22 
 
 
338 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.75 
 
 
298 aa  47.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2598  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 
307 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0138317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.97 
 
 
332 aa  47  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.89 
 
 
336 aa  46.6  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 
265 aa  46.6  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 
290 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  30.47 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.42 
 
 
345 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  28.89 
 
 
206 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  22.59 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3065  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.13 
 
 
330 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.67 
 
 
337 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0823  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.35 
 
 
342 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0317783  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.88 
 
 
337 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0422  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0069051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.41 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.49 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1031  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.13 
 
 
338 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  33.65 
 
 
326 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 
359 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.51 
 
 
330 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.03 
 
 
298 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.57 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 
337 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.04 
 
 
529 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1360  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 
318 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1832  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.11 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.45 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  26.71 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.89 
 
 
337 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.05 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>