85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2730 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  92.06 
 
 		 441 aa  847    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  79.59 
 
 		 443 aa  749    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  73.06 
 
 		 440 aa  692    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  86.17 
 
 		 445 aa  805    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  73.12 
 
 		 444 aa  698    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  79.37 
 
 		 441 aa  749    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  100 
 
 		 441 aa  915    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  60.09 
 
 		 443 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  48.82 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  44.11 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  43.16 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  42.48 
 
 		 421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  39.71 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  42.55 
 
 		 491 aa  317  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  43.09 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  39.86 
 
 		 423 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  39.81 
 
 		 446 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  39.53 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  39.58 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  40.64 
 
 		 444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  40.19 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.01 
 
 		 426 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 		 481 aa  275  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  27.72 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.18 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0665  radical SAM domain-containing protein  25.46 
 
 		 297 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 335 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 275 aa  54.3  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  25.43 
 
 		 336 aa  53.5  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 337 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  27.78 
 
 		 215 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0354  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.880417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  22.18 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  24.26 
 
 		 379 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  23.21 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  26.7 
 
 		 353 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  27.22 
 
 		 535 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 360 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1454  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.54 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5047  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.81 
 
 		 353 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1360  Radical SAM domain protein  27 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 336 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  29.1 
 
 		 206 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 197 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  25.11 
 
 		 303 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 337 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.34 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  25 
 
 		 354 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0586  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 318 aa  47  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 337 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  26.73 
 
 		 427 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.76 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0575  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0300  Radical SAM domain protein  26 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.22 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.56 
 
 		 531 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  22.68 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.59 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  33.77 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 336 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 344 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  40.68 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  22 
 
 		 296 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  22.5 
 
 		 332 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 342 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  23.08 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  29.89 
 
 		 335 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 380 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 299 aa  43.5  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0422  Radical SAM domain protein  24.42 
 
 		 273 aa  43.1  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0069051  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2107  MoaA/NifB/PqqE family nitrogen fixation protein  26.7 
 
 		 297 aa  43.1  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.82 
 
 		 468 aa  43.1  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.89 
 
 		 423 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  20 
 
 		 333 aa  43.1  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>