41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0860 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  80.95 
 
 		 441 aa  764    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 441 aa  922    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  97.96 
 
 		 443 aa  908    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  72.77 
 
 		 440 aa  682    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  83.9 
 
 		 445 aa  794    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  73.18 
 
 		 444 aa  698    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  79.37 
 
 		 441 aa  749    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  58.5 
 
 		 443 aa  554  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  46.35 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  43.79 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  41.04 
 
 		 431 aa  342  7e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  41.01 
 
 		 426 aa  333  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  39.23 
 
 		 418 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  39.81 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  40.19 
 
 		 491 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  39.07 
 
 		 446 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  40.19 
 
 		 511 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  40.33 
 
 		 421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  39.82 
 
 		 444 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 		 427 aa  308  9e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  38.84 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  38.84 
 
 		 446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.11 
 
 		 426 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  38.28 
 
 		 481 aa  279  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  29.05 
 
 		 215 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  23.96 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 337 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5047  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.42 
 
 		 353 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  35.63 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  28.24 
 
 		 354 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.91 
 
 		 333 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  28.35 
 
 		 206 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  29.07 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 197 aa  44.3  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 351 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 340 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  24.69 
 
 		 342 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0398  radical SAM protein  23.86 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0578367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.59 
 
 		 348 aa  43.1  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2107  MoaA/NifB/PqqE family nitrogen fixation protein  23.4 
 
 		 297 aa  43.1  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>