31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3074 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 431 aa  899    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  47.42 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  46.3 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  45.52 
 
 		 491 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  45.65 
 
 		 426 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  43.16 
 
 		 441 aa  349  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  42.14 
 
 		 426 aa  348  8e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  42.92 
 
 		 445 aa  348  9e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  42.51 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  42.45 
 
 		 441 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  41.75 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  41.04 
 
 		 441 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  42.15 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  45.04 
 
 		 511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  40.38 
 
 		 444 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  42.22 
 
 		 481 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  41.05 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 		 418 aa  266  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  37.79 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  37.56 
 
 		 446 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  37.09 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  38.11 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  19.7 
 
 		 362 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  27.48 
 
 		 206 aa  43.9  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  20.3 
 
 		 339 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  21.16 
 
 		 386 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  29.67 
 
 		 342 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>