26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2405 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 418 aa  870    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  47.27 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  40.24 
 
 		 440 aa  326  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  40.19 
 
 		 443 aa  326  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  39.71 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  43.17 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  39.23 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  39.47 
 
 		 445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  39.57 
 
 		 441 aa  319  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 		 444 aa  319  6e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  38.52 
 
 		 443 aa  315  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  42.22 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  41.98 
 
 		 446 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  42.35 
 
 		 446 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  40.62 
 
 		 491 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 		 511 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  38.2 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  37.62 
 
 		 423 aa  285  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  38.31 
 
 		 440 aa  278  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  40.05 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  36.56 
 
 		 443 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  38.97 
 
 		 481 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  37.05 
 
 		 431 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.02 
 
 		 426 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.78 
 
 		 329 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 468 aa  43.1  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>