More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1318 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1318  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.31197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3527  uracil phosphoribosyltransferase  53.77 
 
 		 212 aa  236  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  43.06 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  42.03 
 
 		 211 aa  161  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32758  predicted protein  39.9 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278364  normal  0.120545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  40.58 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  41.55 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  41.43 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  40.58 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  40.19 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  38.76 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  40.95 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  154  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  40.95 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1715  uracil phosphoribosyltransferase  39.22 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  40.19 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4070  uracil phosphoribosyltransferase  42.38 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  39.61 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2191  uracil phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  37.68 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 303 aa  150  1e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1394  uracil phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.588374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  38.65 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0581  uracil phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  39.61 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0992  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 		 216 aa  148  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0752751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  37.68 
 
 		 211 aa  147  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3111  uracil phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.433103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3489  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.125966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1303  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  42.03 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  39.22 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0377  uracil phosphoribosyltransferase  41.58 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl107  uracil phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>