More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0359 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 598 aa  1229    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  40.91 
 
 		 605 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  40.78 
 
 		 601 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  41.28 
 
 		 624 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  39.67 
 
 		 607 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.96 
 
 		 626 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  39.23 
 
 		 596 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  36.64 
 
 		 595 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  36.64 
 
 		 595 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.78 
 
 		 593 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.13 
 
 		 615 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.65 
 
 		 590 aa  320  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.45 
 
 		 610 aa  303  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  33.06 
 
 		 590 aa  293  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.2 
 
 		 597 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.44 
 
 		 604 aa  290  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.02 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.76 
 
 		 594 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.63 
 
 		 610 aa  273  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  30.62 
 
 		 601 aa  272  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  37.38 
 
 		 597 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.64 
 
 		 597 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.02 
 
 		 618 aa  256  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  42.28 
 
 		 243 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.1 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  24.25 
 
 		 558 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.91 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  27.42 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  35.09 
 
 		 536 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  55.36 
 
 		 112 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  35.09 
 
 		 536 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  32.1 
 
 		 538 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.2 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  30.04 
 
 		 521 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  32.78 
 
 		 521 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.08 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.95 
 
 		 445 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.82 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.71 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.92 
 
 		 450 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  31.92 
 
 		 851 aa  95.1  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  31.37 
 
 		 860 aa  94.4  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 868 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  29.28 
 
 		 864 aa  93.2  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.84 
 
 		 443 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 1085 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  29.89 
 
 		 1186 aa  92  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  28.69 
 
 		 793 aa  91.7  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  31.3 
 
 		 864 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  32.84 
 
 		 968 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  31.01 
 
 		 869 aa  91.7  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  29.8 
 
 		 956 aa  90.9  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 856 aa  90.5  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  28.69 
 
 		 793 aa  90.5  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  29.34 
 
 		 1205 aa  90.1  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  30.16 
 
 		 846 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  32.38 
 
 		 858 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  31.53 
 
 		 1088 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 		 882 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  31.01 
 
 		 896 aa  88.6  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 		 882 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 840 aa  88.2  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  29.01 
 
 		 895 aa  87.8  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  29.76 
 
 		 846 aa  87.4  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  30.18 
 
 		 872 aa  87.4  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  29.63 
 
 		 931 aa  87  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  29.96 
 
 		 886 aa  87  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  30.77 
 
 		 897 aa  87  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  28.02 
 
 		 819 aa  87  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  29.88 
 
 		 860 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 892 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 890 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 894 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 892 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  25.62 
 
 		 892 aa  86.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 892 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 892 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  30.04 
 
 		 895 aa  85.5  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  30.5 
 
 		 867 aa  85.1  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  30.99 
 
 		 903 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  31.56 
 
 		 863 aa  85.5  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 890 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 892 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  28.15 
 
 		 882 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 892 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 890 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  28.97 
 
 		 873 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 905 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  31.15 
 
 		 881 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  27.61 
 
 		 883 aa  84.3  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59113  predicted protein  26.69 
 
 		 910 aa  84.3  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  27.31 
 
 		 868 aa  84.3  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81012  Mismatch repair ATPase MSH6 (MutS family)  27.24 
 
 		 1212 aa  83.6  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833152 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  27.09 
 
 		 872 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  29.81 
 
 		 769 aa  83.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  32.2 
 
 		 863 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  32.24 
 
 		 872 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  27.09 
 
 		 872 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  29.05 
 
 		 918 aa  82.8  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  26.91 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>