183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_680 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  100 
 
 		 371 aa  751    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  84.91 
 
 		 370 aa  646    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  81.67 
 
 		 370 aa  622  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  34.51 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  34.24 
 
 		 380 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  36.12 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  36.19 
 
 		 379 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  36.92 
 
 		 397 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  35.03 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  34.68 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  31.68 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  29.89 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  32.29 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  34.4 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  32.89 
 
 		 396 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  34.4 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  34.4 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  33.24 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  32.04 
 
 		 373 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  30.83 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  32.29 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  30.56 
 
 		 374 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  34.64 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  33.43 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  33.33 
 
 		 373 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  29.72 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  28.85 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  29.5 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  28.84 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  29.6 
 
 		 381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  29.33 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  27.66 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  31.05 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  30.15 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  34.12 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  31.7 
 
 		 244 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  31.5 
 
 		 364 aa  132  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  37.44 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  26.3 
 
 		 424 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  30 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  28.19 
 
 		 362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  31.75 
 
 		 416 aa  126  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  37.78 
 
 		 377 aa  127  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  27.68 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  30.94 
 
 		 361 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  27.4 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  28.85 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  27.75 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  28.96 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 		 378 aa  122  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  27.06 
 
 		 378 aa  122  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  29.18 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  31.6 
 
 		 413 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  30.64 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  30.69 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  28.28 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  32.14 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  27.35 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  37.95 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  26.72 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  36.61 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  24.65 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  31.94 
 
 		 422 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  26.91 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  29.22 
 
 		 239 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  29.75 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  31.71 
 
 		 412 aa  106  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  28.96 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  30.8 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  27.35 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  26.42 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  30.87 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  33.66 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  32 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05641  Zn-dependent protease  22.78 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.394997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  28.1 
 
 		 387 aa  99.4  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  33.65 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  26.23 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  40.85 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  27.96 
 
 		 343 aa  98.6  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  30.93 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05941  Zn-dependent proteases  24.11 
 
 		 407 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  35.44 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  27.62 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  25.34 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  25.4 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  27.14 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  34 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  27.36 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0538  hypothetical protein  25.47 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.428838  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  37.76 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  39.74 
 
 		 293 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  35.14 
 
 		 285 aa  90.1  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  28 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  31.13 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  31.15 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  28.52 
 
 		 272 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  25.68 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  27.51 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  25.6 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>