254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_189 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_189  glycosyltransferase domain protein  100 
 
 		 335 aa  694    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0117061  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0152  glycosyl transferase, group 1  88.36 
 
 		 335 aa  620  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.151693  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0201  glycosyl hydrolase domain-containing protein  83.53 
 
 		 392 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179492  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2798  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.09 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 410 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  22.08 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 623 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0967  hypothetical protein  22.54 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2193  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0310577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 396 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 		 396 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 391 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  22.96 
 
 		 385 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  22.18 
 
 		 399 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2336  glycosyl transferase, group 1  20.23 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000420527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 		 378 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  27.64 
 
 		 392 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  21.27 
 
 		 382 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0308  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 364 aa  52.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429385  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  25.23 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 		 389 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  21.27 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  23.51 
 
 		 381 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  27.32 
 
 		 501 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  22.76 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.85 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 		 406 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 		 412 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 406 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0659  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 379 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 		 398 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  21.53 
 
 		 417 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  25.33 
 
 		 431 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  29.41 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  25.85 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  23.4 
 
 		 382 aa  50.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.85 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 		 394 aa  50.1  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 394 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 401 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 389 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  22.59 
 
 		 426 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 392 aa  49.7  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  21.6 
 
 		 406 aa  49.3  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.34 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  24.29 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 		 412 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>